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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001791`

染色体: Chr04 坐标: 29352493-29353005 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001791`
名称	SmilChr04G001791
描述	uncharacterized SmilChr04G001791
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29352493 - 29353005 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023255`
GeneID	`131023255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023255`
原始查询	`LOC131023255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0616600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0616600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=24.3; qcov=0.8; evalue=4.94e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0616600` - identity=48.4; qcov=0.376; evalue=4.27e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808781.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808781.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808781.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808781.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29352675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A20,A22,B1,B110,B120,B19,B58,B74,B97,C28,C36,C50,D5
`Chr4:29352681`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A15,A16,A2,A3,B106,B118,B130,B137,B138,B140,B27,B42,B43,B51,B54,B70,B80,B84,B9,B91,C14,C21,C35,C41,C43,C47,C52,C58,C60,C65,C70,C77,C78,C80,C86
`Chr4:29352752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:29352760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr4:29352790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:29352797`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr4:29352797`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr4:29353003`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr4:29353003`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808781.1

170 aa

170

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 26-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808781.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	26	103	8.8e-16	59.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952798.1
ATGGTGGAGAAACATGAGGGATCCGTTGATAAGGCGCAAGTGGCCCTTAATAGTTGGGGTGGCGAAAATCTCACGGCTGAAGCGTACAACTGTTTCCGGGACAAGGGCGAGGCACTATTTTGGCACAAGGCAATTTGGAGAAACTACATTCCTCCAAGATGCTCTATCACCCTTTGGCTTGCATTACAAAATCGGCTCAAAACAGTGGATCGACTCCAGGGAGTTCCTAAACTTTATGCTATTTGCAATACTTGTGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023255
ATGGTGGAGAAACATGAGGGATCCGTTGATAAGGCGCAAGTGGCCCTTAATAGTTGGGGTGGCGAAAATCTCACGGCTGAAGCGTACAACTGTTTCCGGGACAAGGGCGAGGCACTATTTTGGCACAAGGCAATTTGGAGAAACTACATTCCTCCAAGATGCTCTATCACCCTTTGGCTTGCATTACAAAATCGGCTCAAAACAGTGGATCGACTCCAGGGAGTTCCTAAACTTTATGCTATTTGCAATACTTGTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808781.1
MVEKHEGSVDKAQVALNSWGGENLTAEAYNCFRDKGEALFWHKAIWRNYIPPRCSITLWLALQNRLKTVDRLQGVPKLYAICNTCDESLEHLYFKCVETSKTWREIKKWLRLKELMSTIPSAIKHLSKKNKGSKIYNKAKLLSLVVMVNHLWFARNKLIFEKEPREECGV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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