当前解析结果
SmilChr04G001802| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001802 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001802 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001802 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 29511660 - 29513232 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023257 |
|---|---|
| GeneID | 131023257 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023257 |
| 原始查询 | LOC131023257 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=42.5; qcov=0.322; evalue=3.57e-31; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023257 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808783.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057808783.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057808783.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808783.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808783.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:29511698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B45 |
Chr4:29511809 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B33,B66,B68,B85,C63 |
Chr4:29512501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr4:29512501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:29512511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:29512520 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B71,C53,C78,D2 |
Chr4:29512549 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B117,D11 |
Chr4:29512553 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B13,B42,B63,B69,C58,C68,D11 |
Chr4:29512556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B23,C29 |
Chr4:29512569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,B90,C53,D8 |
Chr4:29512600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr4:29512603 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,B61,C55,C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。