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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001832`

染色体: Chr04 坐标: 29874861-29876081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001832`
名称	SmilChr04G001832
描述	uncharacterized SmilChr04G001832
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29874861 - 29876081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023262`
GeneID	`131023262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023262`
原始查询	`LOC131023262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=42.7; qcov=1.04; evalue=5.9e-99; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=37.3; qcov=1.04; evalue=8.34e-73; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808789.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808789.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808789.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808789.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29874885`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	11	A18,A24,B101,B113,B128,B135,B26,B3,B9,C40,C54
`Chr4:29874887`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A16,B119,B124,B126,B130,B133,B23,B59,B75,B79,C16,C17,C43,C62,D3
`Chr4:29874896`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr4:29874896`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46
`Chr4:29874903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C60
`Chr4:29874905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C38,C60
`Chr4:29874905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C60
`Chr4:29874909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C60
`Chr4:29874911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:29874921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:29874935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:29874939`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808789.1

377 aa

188

377

DUF4371

PF14291 DUF4371 4-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808789.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	4	221	3.7e-87	292.5	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952806.1
ATGACATTAGAAAAGTTTGTAGAGCATGTTGGAGATGCCAATAGCTGTAACAATAATGCTAGAATACAATTTGAAGCATTTAAAGATCAAAGACATAGTGTGGCAAATATGTTTAGATCAAATGCTCGTGAGGTGGATGTTGCTTATCGCTTCCATTTGACGGCTTCATTGGTTGTGACTCGTTTTCTATTGAAGCAAAGATTGCCTTTTCGTGGACATGATGAGTCAACTAGTTCTTCAAATCGAGGTAATTTTCTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023262
ATGACATTAGAAAAGTTTGTAGAGCATGTTGGAGATGCCAATAGCTGTAACAATAATGCTAGAATACAATTTGAAGCATTTAAAGATCAAAGACATAGTGTGGCAAATATGTTTAGATCAAATGCTCGTGAGGTGGATGTTGCTTATCGCTTCCATTTGACGGCTTCATTGGTTGTGACTCGTTTTCTATTGAAGCAAAGATTGCCTTTTCGTGGACATGATGAGTCAACTAGTTCTTCAAATCGAGGTAATTTTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808789.1
MTLEKFVEHVGDANSCNNNARIQFEAFKDQRHSVANMFRSNAREVDVAYRFHLTASLVVTRFLLKQRLPFRGHDESTSSSNRGNFLELLQWYSDHNDVVSKVLGSNAPANNQMTSPQIQKDLARACASEVTLAIINDIGDKVFTIMIDEARDVLLKEQMGVVFRYVNGEGCVIERFIGIAHVVDICSHSLKDAISDLFEKHGLYLSKLRGQGYDGATNIRASIIIAKNIMSVKDFCSYVSMIVHTTGASCKRKDQLRMLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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