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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001833`

染色体: Chr04 坐标: 29882404-29883489 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001833`
名称	SmilChr04G001833
描述	uncharacterized SmilChr04G001833
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29882404 - 29883489 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023263`
GeneID	`131023263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023263`
原始查询	`LOC131023263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=25.7; qcov=1.05; evalue=4.38e-24; confidence=low
Rice	`Os01g0967700` - identity=25.3; qcov=0.712; evalue=3.41e-10; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808791.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808791.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808791.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808791.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29882415`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B136,B20
`Chr4:29882436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:29882459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B12,D10
`Chr4:29882483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C10,C7,C79
`Chr4:29882550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B12,D10,D11
`Chr4:29882566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,B101,B117,B24,B85,B87,B99,C44,D6
`Chr4:29882570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	107	A1,A15,A16,A19,A2,A3,A8,A9,B104,B105,B106,B108,B109,B111,B12,B122,B123,B127,B129,B130,B132,B133,B137,B138,B139,B16,B2,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B32,B33,B37,B4,B42,B43,B46,B47,B49,B50,B51,B55,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B70,B74,B77,B79,B83,B84,B86,B89,B9,B91,B98,C14,C15,C18,C2,C20,C21,C22,C25,C26,C27,C28,C29,C34,C36,C39,C4,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C52,C59,C60,C63,C64,C65,C66,C70,C72,C73,C75,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D2,D5,D6,D8
`Chr4:29882576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A16,B119,B124,B126,B130,B133,B16,B23,B59,B79,B86,C16,C17,C23,C43,C62,D11,D3
`Chr4:29882610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C49
`Chr4:29882633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B53
`Chr4:29882638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B38,B39,C13,C41
`Chr4:29882651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808791.1

361 aa

180

361

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 26-119 aa PF13456 RVT_3 226-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808791.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	26	119	9e-16	59.0	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057808791.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	226	339	3.1e-16	60.1	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952808.1
ATGTCGAAGTTTGTAGCCAAACTTAAGCATTCGGTCGTTGATAGGCCTTTTTGGCCAATTGGCAAACTTAACTCCTATTCGGTCAAATCGGGTTATATTTTGGCTAATTCTATCAAGCAAAGAAATGAGGCCTCGTCGTCTTCCCTGAAGGCTGATCTTTGGCAGTGGGTTTGGGGACTGGAGGTTATCTCAAAGGTTAAATTGTTCATGTGGAAGTGCTTAGTTGGGGCCCTTCCTACGACTTATGCTCTTTCTCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023263
ATGTCGAAGTTTGTAGCCAAACTTAAGCATTCGGTCGTTGATAGGCCTTTTTGGCCAATTGGCAAACTTAACTCCTATTCGGTCAAATCGGGTTATATTTTGGCTAATTCTATCAAGCAAAGAAATGAGGCCTCGTCGTCTTCCCTGAAGGCTGATCTTTGGCAGTGGGTTTGGGGACTGGAGGTTATCTCAAAGGTTAAATTGTTCATGTGGAAGTGCTTAGTTGGGGCCCTTCCTACGACTTATGCTCTTTCTCGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808791.1
MSKFVAKLKHSVVDRPFWPIGKLNSYSVKSGYILANSIKQRNEASSSSLKADLWQWVWGLEVISKVKLFMWKCLVGALPTTYALSRRAMDVDLMCRRCGEHEETLEHAIRDCHWASFLWECSPLRLPPVSVSDQCSVDVWFDRIRKIPHAEVHNSFATLTWSIWYARNVFLFQGKTISHEECLAISLRATWSPPFSSPPMSGGPRCVICSRDNQILISCDAAIDNNGGMGYGTVLTNFQGNIAGCSFGFLEGAYTAEEGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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