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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001840`

染色体: Chr04 坐标: 29931533-29932219 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001840`
名称	SmilChr04G001840
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29931533 - 29932219 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023264`
GeneID	`131023264`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023264`
原始查询	`LOC131023264`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415]; symbol=CRK8; hit=AT4G23160; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415]; symbol=CRK8; hit=AT4G23160; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=35.9; qcov=0.718; evalue=2.65e-19; confidence=low
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=33.9; qcov=0.798; evalue=2.43e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023264

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808792.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808792.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808792.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808792.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29931542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C7
`Chr4:29931559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C30,C49
`Chr4:29931593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B62,B67
`Chr4:29931829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:29931862`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	118	A1,A11,A13,A16,A18,A22,A23,A25,A5,A7,A8,B1,B10,B104,B105,B107,B11,B110,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B125,B128,B129,B131,B134,B135,B139,B14,B15,B18,B19,B20,B22,B23,B25,B28,B30,B34,B35,B36,B38,B39,B44,B46,B48,B50,B53,B55,B58,B61,B65,B66,B69,B71,B72,B73,B78,B79,B8,B81,B82,B86,B88,B90,B91,B92,B93,B97,B98,C1,C10,C13,C16,C18,C21,C22,C23,C29,C31,C33,C34,C36,C37,C41,C43,C44,C48,C5,C50,C56,C57,C58,C6,C62,C67,C7,C71,C75,C76,C79,C80,C81,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D7
`Chr4:29931869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B1,B42,B43,C50
`Chr4:29931935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B88,C7,C76,D1
`Chr4:29932045`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A14,A6,A7,B103,B106,B107,B11,B113,B121,B134,B138,B19,B29,B34,B37,B40,B41,B45,B5,B61,B7,B72,B73,B80,B83,B87,B94,B97,C12,C15,C24,C26,C3,C38,C40,C51,C56,C61,C64,C66,C77,C78,C81,D1,D2,D9
`Chr4:29932084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:29932138`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B107,B62,B83,B95,C38,C55,C59,D7
`Chr4:29932140`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B107,B62,B83,B95,C38
`Chr4:29932140`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B107,B62,B83,B95,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808792.1

163 aa

163

RVT_2

PF07727 RVT_2 31-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808792.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	31	127	2e-18	67.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952809.1
ATGAATCATATTCCCAGGATTCATATTCCCAGAAATCATATTCCCAGACAATATTACTTTCCTGCCAAACAAACAGGGCCTAAGAGATTTGTCTCTGATCATTCCCTCTTCTACAAACATTCTAATGGCGCACTTCTCCTCATTCTCATCTATGTTGATGATATACTCATCACCGAACATAGTTCTTCTGAAGTTCTGAGTCTCATTGATCTACTGCACAACAAGTTTGCTCTCACTTCCTTGGGTTCAGTTCACTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023264
ATGAATCATATTCCCAGGATTCATATTCCCAGAAATCATATTCCCAGACAATATTACTTTCCTGCCAAACAAACAGGGCCTAAGAGATTTGTCTCTGATCATTCCCTCTTCTACAAACATTCTAATGGCGCACTTCTCCTCATTCTCATCTATGTTGATGATATACTCATCACCGAACATAGTTCTTCTGAAGTTCTGAGTCTCATTGATCTACTGCACAACAAGTTTGCTCTCACTTCCTTGGGTTCAGTTCACTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808792.1
MNHIPRIHIPRNHIPRQYYFPAKQTGPKRFVSDHSLFYKHSNGALLLILIYVDDILITEHSSSEVLSLIDLLHNKFALTSLGSVHYFLGIEVTKSGPSYALCQSKYLKKLLEKTNMSSCHPCSTPMTPATRLSKKGDANYASCIDDRRNTWFLEAAQNTNTGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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