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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001843`

染色体: Chr04 坐标: 29965336-29967223 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001843`
名称	SmilChr04G001843
描述	uncharacterized SmilChr04G001843
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29965336 - 29967223 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023265`
GeneID	`131023265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023265`
原始查询	`LOC131023265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=39.3; qcov=0.366; evalue=2.46e-24; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808793.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808793.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808793.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808793.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29965342`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	156	A10,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A25,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B54,B55,B58,B59,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B87,B89,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C24,C26,C27,C28,C3,C34,C35,C36,C4,C40,C42,C45,C47,C48,C5,C50,C53,C54,C58,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C71,C72,C74,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C9,D10,D2,D3,D4,D5
`Chr4:29965345`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	112	A18,A2,A20,A21,A23,A25,A7,A9,B1,B101,B102,B108,B11,B110,B111,B112,B115,B124,B125,B127,B128,B13,B131,B133,B134,B136,B139,B14,B16,B18,B2,B20,B22,B24,B25,B28,B33,B35,B37,B38,B41,B42,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B54,B55,B58,B59,B64,B67,B68,B69,B7,B71,B74,B75,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B85,B87,B89,B94,B95,B97,B98,C13,C15,C16,C17,C2,C21,C22,C24,C26,C27,C28,C35,C36,C4,C40,C42,C45,C47,C48,C5,C53,C54,C58,C59,C6,C60,C64,C65,C66,C74,C78,C83,C85,C9,D10,D2,D4,D5
`Chr4:29965348`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A10,A19,A2,B100,B101,B106,B113,B121,B124,B130,B138,B140,B24,B26,B30,B34,B39,B40,B48,B64,B69,B70,B77,B79,B84,B87,B93,B95,B98,B99,C1,C14,C18,C34,C4,C48,C50,C58,C6,C64,C71,C72,C74,C78,C8,C80,C84,D2
`Chr4:29965352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A20,B123,B80
`Chr4:29965368`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B76
`Chr4:29965368`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B76
`Chr4:29965379`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A23,B110,B112,B20,B22,B44,B47,B65,B71,B74,C74,C83,C85
`Chr4:29965385`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A10,B100,B30,B48,B64,B70,B98,C1,C34,C50,C64,D2
`Chr4:29965409`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A18,B102,B111,B127,B24,B3,B37,B51,B54,C17,C27,C36,C45,C64,C66
`Chr4:29965457`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr4:29965457`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr4:29966346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C30,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952810.1
ATGGGTAGATGGATCTCAAAGGGGCTGATCAGAGCTCATTCAAGTGTCATCCGACCAGATTTGACAGCTCCCAACAAGTTATTGAGGCTTCAGTTCTCTCTCGAACACATTGTGTATGATAGGATATGCAATGTCCTAAAGTTCAAGAATATGCACAATGTCGTGCATGTTGATGAGAAGTGGTTCTACATCACCAAATCAAATCACAAATTTTACTTGACTCCAGCAGAAATAGATCCACATTGCACATGCAAAAGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023265
ATGGGTAGATGGATCTCAAAGGGGCTGATCAGAGCTCATTCAAGTGTCATCCGACCAGATTTGACAGCTCCCAACAAGTTATTGAGGCTTCAGTTCTCTCTCGAACACATTGTGTATGATAGGATATGCAATGTCCTAAAGTTCAAGAATATGCACAATGTCGTGCATGTTGATGAGAAGTGGTTCTACATCACCAAATCAAATCACAAATTTTACTTGACTCCAGCAGAAATAGATCCACATTGCACATGCAAAAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808793.1
MGRWISKGLIRAHSSVIRPDLTAPNKLLRLQFSLEHIVYDRICNVLKFKNMHNVVHVDEKWFYITKSNHKFYLTPAEIDPHCTCKSKKFIKKVMFVCAVCRPLFNEDGSVLFDGKIGIFPFTEMVPAKRTSKNREAGTMEEKPIQSITKQVMKDCFIYKAWKTDELSIMAKWPQFASKTIYIQQDNAKPHIKDSDPDFRAAATANDFDIKIVHQPPNSPDTNINDLGWFRAIQSLQVQSVYTNEGELVKAVQKSYEELSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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