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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr04G001867

染色体: Chr04 坐标: 30460860-30462507 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr04G001867
名称SmilChr04G001867
描述uncharacterized SmilChr04G001867
染色体 / SeqIDChr04 / NC_080390.1
坐标与链方向30460860 - 30462507 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131023273
GeneID131023273
locus_tag-
NCBI NameLOC131023273
原始查询LOC131023273

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131023273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057808803.1
2 Chromosome 染色体 1.00000 XP_057808803.1
3 Nucleoplasm 核质 1.00000 XP_057808803.1
4 Chromatin 染色质 0.20000 XP_057808803.1
5 Nuclear body 核内小体 0.20000 XP_057808803.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr4:30461982 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C81,C87
Chr4:30462002 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C81,C87
Chr4:30462036 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A1
Chr4:30462037 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 C43,C81,C87
Chr4:30462058 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A15
Chr4:30462094 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A15
Chr4:30462102 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C81,C87
Chr4:30462108 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A15
Chr4:30462113 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C81,C87
Chr4:30462147 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C15,C86
Chr4:30462156 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 60 A15,A20,A6,A8,B10,B100,B106,B11,B123,B133,B136,B137,B17,B18,B19,B25,B26,B32,B33,B34,B36,B41,B47,B50,B51,B52,B57,B60,B63,B72,B73,B77,B79,B81,B83,B86,B87,B88,B9,B93,C10,C18,C2,C26,C28,C3,C35,C36,C39,C40,C41,C5,C51,C6,C71,C75,C77,C82,C87,D11
Chr4:30462162 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 34 A20,A6,A8,B10,B106,B137,B18,B19,B25,B32,B33,B34,B41,B50,B52,B60,B63,B72,B73,B79,B81,B83,B86,B9,C10,C26,C28,C35,C36,C41,C6,C75,C82,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057952820.1
ATGGCAAAAACCAAAGGAGGAACTGGCTCCGGAAGCACCCAACCCCCGAAGAAGAAGAACACCAAACCCCCACCTCCAAAGCGGACCACGAGGCGAACCGCTTCGGAGGAGACCTCCACCAAAGTCATTGAAGACCCTTTGCTGACTATTCAACCCGAGGACAGAGGGCGTGCCGAAGTCCTTCAACAAGAGGAACGTGAGGACGCAAGAACAGCCGCTGAGTCAAAACAACCGGAGAAACCGGACGAAGAGGAACCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131023273
ATGGCAAAAACCAAAGGAGGAACTGGCTCCGGAAGCACCCAACCCCCGAAGAAGAAGAACACCAAACCCCCACCTCCAAAGCGGACCACGAGGCGAACCGCTTCGGAGGAGACCTCCACCAAAGTCATTGAAGACCCTTTGCTGACTATTCAACCCGAGGACAGAGGGCGTGCCGAAGTCCTTCAACAAGAGGAACGTGAGGACGCAAGAACAGCCGCTGAGTCAAAACAACCGGAGAAACCGGACGAAGAGGAACCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057808803.1
MAKTKGGTGSGSTQPPKKKNTKPPPPKRTTRRTASEETSTKVIEDPLLTIQPEDRGRAEVLQQEEREDARTAAESKQPEKPDEEEPEFSPPVKKSKKAQMGKATPARSIVAPPPVQAQPQPQIPETSMQEERTASEDTEGEEQEKAEEEKVEEEKMDEEEADEQEEVEAVQEEEVEVPIPQSKRPGVKMKLDVAKPPLPVKARPAPAGRKDTDEN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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