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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001923`

染色体: Chr04 坐标: 31340151-31341836 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001923`
名称	SmilChr04G001923
描述	uncharacterized SmilChr04G001923
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31340151 - 31341836 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023283`
GeneID	`131023283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023283`
原始查询	`LOC131023283`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=30.4; qcov=0.262; evalue=4.44e-12; confidence=weak
Rice	`Os03g0643433` - identity=24.1; qcov=0.922; evalue=1.13e-26; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808813.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808813.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808813.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808813.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808813.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31340156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:31340167`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A19,A24,B101,B62,B73,C32,C68,C83,D11
`Chr4:31340235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A13,A15,A23,B104,B106,B108,B122,B13,B131,B135,B137,B22,B23,B28,B47,B56,B62,B7,B79,B86,B89,B90,B92,B96,C13,C14,C16,C31,C39,C40,C48,C56,C57,C70,C77,D4,D8
`Chr4:31340236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A14,A20,A3,B127,B128,B133,B140,B23,B41,B44,B69,B72,B84,B87,C17,C27,C31,C61,C69,C77,C82,C85,D2,D3,D9
`Chr4:31340258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C25
`Chr4:31340281`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B92
`Chr4:31340281`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B92
`Chr4:31340282`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr4:31340282`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr4:31340285`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr4:31340285`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr4:31340293`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808813.1

477 aa

238

477

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 307-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808813.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	307	374	1.9e-14	54.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952830.1
ATGGAGATTGGAAAAGATAAGATTAAAGTGTCACACCTTCAATATGCCGACGATACAATCTTCCTTTTAGAAGACTCCGATGGTAACATTGAAGCGGTGAAATGGCTCTTGAAGCTCTTCCACTTTTTATCTGGGCTCACTGTGAATTTCAAGAAATGCAGCTTAATCGGCATAATGGTTGACGGTGACAAGCTTACTCGCATGGCCGCTGAACTGAACTGCAAAGTTGACTGCTGCCCTTTTTCATACTTAGGTCAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023283
ATGGAGATTGGAAAAGATAAGATTAAAGTGTCACACCTTCAATATGCCGACGATACAATCTTCCTTTTAGAAGACTCCGATGGTAACATTGAAGCGGTGAAATGGCTCTTGAAGCTCTTCCACTTTTTATCTGGGCTCACTGTGAATTTCAAGAAATGCAGCTTAATCGGCATAATGGTTGACGGTGACAAGCTTACTCGCATGGCCGCTGAACTGAACTGCAAAGTTGACTGCTGCCCTTTTTCATACTTAGGTCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808813.1
MEIGKDKIKVSHLQYADDTIFLLEDSDGNIEAVKWLLKLFHFLSGLTVNFKKCSLIGIMVDGDKLTRMAAELNCKVDCCPFSYLGQIIGGGNNKVADWQFLEEKIKRRIESWKNQKLALEGRITLVKAVLQAIPVFHLSFALIPKTTVHSINSLCGGGNLWAKIIRSVYGDVVWGSEGLEIRGNQRSKSSWWGKIVEGGRGVTTKWFENNLVKSIGNGRETLFWEHRWVGNQPLKIRFPRLYFISSQKGNSISDMGSWED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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