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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001968`

染色体: Chr04 坐标: 31895723-31900457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001968`
名称	SmilChr04G001968
描述	uncharacterized SmilChr04G001968
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31895723 - 31900457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023305`
GeneID	`131023305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023305`
原始查询	`LOC131023305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.8; qcov=0.771; evalue=1.67e-46; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.3; qcov=0.778; evalue=2.44e-58; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808835.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808835.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808835.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808835.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31895744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B130,B70,C52,C60,C65,C70,C80
`Chr4:31895793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:31895800`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:31895800`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:31895802`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B126,B58,C13
`Chr4:31895802`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B126,B58,C13
`Chr4:31895805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:31898354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr4:31898422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B13,B35
`Chr4:31898469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C15
`Chr4:31898469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:31898554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808835.1

725 aa

362

725

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 340-434 aa PF00872 Transposase_mut 357-510 aa PF04434 SWIM 585-615 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808835.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	340	434	2.9e-19	69.9	MULE transposase domain
`XP_057808835.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	357	510	4.3e-11	43.0	Transposase, Mutator family
`XP_057808835.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	585	615	7.1e-08	32.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952852.1
ATGTTTCTTAAGAAAAATAGTCAGAACGACTTTGACCATCCTGATGGATTTGGGCCTATTTCAGAAATCCGGGGTATTAGAGCATTGGCAACACCTTACACGATAGCACCTACTCGTTCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCGTTACAATCGCCTAACAACTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTACGAGCCTCAGTTTGTGGAGAATGCTGGTAATGTAGATGAAGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023305
ATGTTTCTTAAGAAAAATAGTCAGAACGACTTTGACCATCCTGATGGATTTGGGCCTATTTCAGAAATCCGGGGTATTAGAGCATTGGCAACACCTTACACGATAGCACCTACTCGTTCAACGGGTTGGCCTTCATGGGATGAGCCAAATCCGTACCGTTACAATCGCCTAACAACTGATCGTTGTTGGGGTCCAGCTGATGATCAATATACGTACGAGCCTCAGTTTGTGGAGAATGCTGGTAATGTAGATGAAGATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808835.1
MFLKKNSQNDFDHPDGFGPISEIRGIRALATPYTIAPTRSTGWPSWDEPNPYRYNRLTTDRCWGPADDQYTYEPQFVENAGNVDEDYVPSSEAETDTSASEDLSGPENVRRAGIEYAGWQNLQIDDDDDEQVPGADELTNWLVPVIPLDAAAALVDIEDYQLLPRELSKNMYFISKNDLIVAIGLWNMKQGKEFSVSKSDSRRVYFKCKHSDTCPFKLHASSQDGAIWRVYKFTNEHSCDGELGRVARIKAPAKVVATYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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