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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001975`

染色体: Chr04 坐标: 32002398-32003768 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001975`
名称	SmilChr04G001975
描述	uncharacterized SmilChr04G001975
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32002398 - 32003768 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023308`
GeneID	`131023308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023308`
原始查询	`LOC131023308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.4; qcov=0.849; evalue=7.74e-40; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.7; qcov=0.971; evalue=1.77e-45; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808838.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808838.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808838.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808838.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32002420`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	147	A11,A13,A14,A15,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B103,B106,B107,B109,B11,B110,B113,B115,B118,B119,B121,B122,B123,B128,B13,B131,B134,B135,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B2,B20,B23,B26,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B48,B5,B52,B57,B58,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B75,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C40,C43,C47,C48,C49,C50,C51,C53,C56,C6,C61,C62,C65,C68,C7,C71,C73,C74,C77,C79,C8,C81,C82,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D2,D4,D5
`Chr4:32002456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:32002462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B59,C62
`Chr4:32002463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:32002465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,C32,C55,C68
`Chr4:32002466`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A13,A18,A23,A25,A5,A8,B101,B107,B11,B113,B128,B13,B135,B139,B15,B17,B20,B26,B28,B3,B40,B42,B43,B48,B52,B57,B64,B68,B70,B71,B75,B8,B86,B9,B90,B92,B93,C1,C10,C13,C15,C18,C21,C31,C32,C34,C37,C40,C48,C49,C61,C62,C65,C68,C7,C74,C79,C86,C87
`Chr4:32002482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:32002498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C60,D11
`Chr4:32002501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C6
`Chr4:32002517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B85
`Chr4:32002564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr4:32002571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952855.1
ATGGTCCCCCGCCATCAAAATTGTCGACAGCCTCGGAAGTTGAACATCTGGTTGCTCACTAGTCCGTCTGTTCAGACAACAATCTTGCTCTCTTCGGCTCAGGTCATTATTGCTGATTGTGTTTGGCAAACTTACTGCTTTAGAGTCGCGGTTGTGCATGGTGCGAATGATCACGTTGCTAGGCGTGCCTTGTGGACTGATCTTCTTTCTTTTGTTGATGGGAACACGGTTTTTATTGGCGACTTCAACGCCGTCAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023308
ATGGTCCCCCGCCATCAAAATTGTCGACAGCCTCGGAAGTTGAACATCTGGTTGCTCACTAGTCCGTCTGTTCAGACAACAATCTTGCTCTCTTCGGCTCAGGTCATTATTGCTGATTGTGTTTGGCAAACTTACTGCTTTAGAGTCGCGGTTGTGCATGGTGCGAATGATCACGTTGCTAGGCGTGCCTTGTGGACTGATCTTCTTTCTTTTGTTGATGGGAACACGGTTTTTATTGGCGACTTCAACGCCGTCAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808838.1
MVPRHQNCRQPRKLNIWLLTSPSVQTTILLSSAQVIIADCVWQTYCFRVAVVHGANDHVARRALWTDLLSFVDGNTVFIGDFNAVKSAHERRSLVAPLRSSCSEFCDFIEASDMVESPSSGIRFTWSGRRLLPRHVESRLDRAFFTISFANLWASINTHALPRLTSDHSPLIFQCSDDMGKGRRFKFLNMWTSHPNFLERVASSWDAATDVRCPIFKIMFKLCRLRNDLRAWNKEVFGQVDMQINSEQISLLDVQNMISD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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