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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002089`

染色体: Chr01 坐标: 36883067-36884078 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002089`
名称	SmilChr01G002089
描述	chaperone protein dnaJ 20, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36883067 - 36884078 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023309`
GeneID	`131023309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023309`
原始查询	`LOC131023309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 20, chloroplastic-like
产物	chaperone protein dnaJ 20%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G13830` (J20) DNAJ-like 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827017] identity=42.3; qcov=0.946; evalue=1.79e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0101700` (OsDjC1) - identity=50.8; qcov=0.692; evalue=1.89e-33; confidence=medium
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0061077 (GO:0061077)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808841.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057808841.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808841.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808841.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808841.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36883174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A21
`Chr1:36883174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:36883838`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B139,B98,C7
`Chr1:36883838`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B139,B98,C7
`Chr1:36883955`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A16,A20,A21,A23,B1,B11,B111,B123,B135,B18,B45,B50,B56,B60,B69,B77,B78,B83,B96,C16,C2,C25,C3,C34,C40,C50,C53,C59,C72,C78,D10,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808841.1

185 aa

185

DnaJ

PF00226 DnaJ 71-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808841.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	71	135	4.1e-18	65.9	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952858.1
AATAGAGAGTTAGAAAGTTTAAAACATCATTAATGAGGGCCCGGCCCGCACACTCTCTTAATTTCTTCCTATAAATACACTTCCCCAAAATCCACCAAATCACAAACCAAAAAAATAAAAAAATGGGTTCAAAAATCATCATCAGCAATCCAACGCTCCAAATTCACTCAAATGCCAATCAATTTCCCAAAACACATTTCCCCCAAAATATCTCCTACGTGTCCCAGCTCAGCAAATCAAGAATCCCAACCCGAAACCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023309
ATGGGTTCAAAAATCATCATCAGCAATCCAACGCTCCAAATTCACTCAAATGCCAATCAATTTCCCAAAACACATTTCCCCCAAAATATCTCCTACGTGTCCCAGCTCAGCAAATCAAGAATCCCAACCCGAAACCCATCAGGAGCCCCGAGGGCCCACTCCGCGGCCCAAATCTCTGCCTTGTACGCTCCGGCCCAAACCAAGGAAACACTGTATGAACTGCTGGGAATTGCAGAGAACGTGAGCAGCTTTTCCGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808841.1
MGSKIIISNPTLQIHSNANQFPKTHFPQNISYVSQLSKSRIPTRNPSGAPRAHSAAQISALYAPAQTKETLYELLGIAENVSSFSDIKKAYKHMARKYHPDVSPPDRADEYTRRFIMVHEAYETLSNPQTKALYDRDLAVGAAFPNSWRKHQGMEWRSSWQSQLDELQRRDCRERSSWGSRMRKC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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