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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002004`

染色体: Chr04 坐标: 32435983-32437504 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002004`
名称	SmilChr04G002004
描述	uncharacterized SmilChr04G002004
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32435983 - 32437504 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023317`
GeneID	`131023317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023317`
原始查询	`LOC131023317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=35.2; qcov=0.621; evalue=2.17e-35; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808844.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057808844.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808844.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808844.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32436043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:32436044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C37,C61,C69
`Chr4:32436069`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:32436069`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:32436082`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr4:32436082`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr4:32436099`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B58,B66
`Chr4:32436099`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B58,B66
`Chr4:32436108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	51	A24,A4,A5,A9,B100,B117,B131,B134,B135,B21,B30,B35,B36,B42,B43,B48,B5,B54,B6,B71,B75,B76,B78,B81,B82,B91,B93,C16,C17,C19,C22,C25,C30,C31,C32,C35,C37,C39,C45,C46,C48,C53,C6,C61,C67,C68,C7,C74,C79,C83,C86
`Chr4:32436129`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A16,A3,B118,B137,B63,B80,C41,C58,C78
`Chr4:32436138`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A5,B135,B48,C37
`Chr4:32436138`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A5,B135,B48,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952861.1
ATGAGAAAAGATCTAACTACAACATTAAGAAACCAAGTGGTGCAATTCATCCTCCAAGGCAACATCAATGGAAAAGAGCAATATGGCATATTAGAGGAAGCCCGACAGAAATTTTGTACCTCTCGTTCCACTATTGCTCGGCTGTGGAGGTCTGCAAAGAAGCAACATGAAGAAGGCGAAGTTATAAACAGTGTAAGTCGAAAGATTACTACAAAGCGTAGAACTCAAGTTCACCTAGATTTGAGTATTCTTTCAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023317
ATGAGAAAAGATCTAACTACAACATTAAGAAACCAAGTGGTGCAATTCATCCTCCAAGGCAACATCAATGGAAAAGAGCAATATGGCATATTAGAGGAAGCCCGACAGAAATTTTGTACCTCTCGTTCCACTATTGCTCGGCTGTGGAGGTCTGCAAAGAAGCAACATGAAGAAGGCGAAGTTATAAACAGTGTAAGTCGAAAGATTACTACAAAGCGTAGAACTCAAGTTCACCTAGATTTGAGTATTCTTTCAAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808844.1
MRKDLTTTLRNQVVQFILQGNINGKEQYGILEEARQKFCTSRSTIARLWRSAKKQHEEGEVINSVSRKITTKRRTQVHLDLSILSNLEYTKRGTITRLVVGLEISRSTIGRWVKSGKIRAHTSSLKPDLTATKKLLRLRFSLESLELDLKKIKFRDMHNTVHIDEKWFYITRGSHRYYLALGKPEPHRTCKNKKFITKIMFMCAVTRPLIADDGTILFDGKIGIFPSTIQVPAKRNSRNRLADTLETKAIESITKEVIKH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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