当前解析结果
SmilChr04G002009| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002009 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002009 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002009 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 32585835 - 32586596 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023318 |
|---|---|
| GeneID | 131023318 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023318 |
| 原始查询 | LOC131023318 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023318 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808846.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057808846.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057808846.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057808846.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057808846.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:32585863 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C50 |
Chr4:32585864 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B68,C51,D4,D9 |
Chr4:32585877 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr4:32585878 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A3,B137,B80,C41,C58,C59,C84 |
Chr4:32585879 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B14 |
Chr4:32585879 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr4:32585901 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr4:32585932 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B42 |
Chr4:32585945 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B42 |
Chr4:32586054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B30,B45,C2 |
Chr4:32586101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr4:32586155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B5,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。