当前解析结果
SmilChr04G002057| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002057 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002057 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002057 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 33310787 - 33312448 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023326 |
|---|---|
| GeneID | 131023326 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023326 |
| 原始查询 | LOC131023326 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=34.6; qcov=0.48; evalue=1.65e-40; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023326 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808852.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057808852.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808852.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808852.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808852.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:33310801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B12,B140,C61,C64 |
Chr4:33310865 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr4:33310868 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B62 |
Chr4:33310907 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C57 |
Chr4:33310956 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,C2,C61 |
Chr4:33310965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B126,B8,B83,C52 |
Chr4:33310976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B77,C21,C35,C58,D8 |
Chr4:33310978 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C57 |
Chr4:33311006 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C50,C81 |
Chr4:33311012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr4:33311021 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B124 |
Chr4:33311025 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。