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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002087`

染色体: Chr04 坐标: 33643600-33644055 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002087`
名称	SmilChr04G002087
描述	uncharacterized SmilChr04G002087
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33643600 - 33644055 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023330`
GeneID	`131023330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023330`
原始查询	`LOC131023330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057808857.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808857.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808857.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808857.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33643616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B1,B133,B37,C75
`Chr4:33643617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr4:33643623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B31
`Chr4:33643632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr4:33643655`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B1,B103,B133,B37,B65,C64,C75,D2,D5
`Chr4:33643679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B1,B12,B37,B67,C6,D5
`Chr4:33643684`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B12,B67
`Chr4:33643684`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B12,B67
`Chr4:33643685`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	160	A1,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B122,B123,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B4,B45,B47,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B82,B83,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C44,C45,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C72,C73,C74,C76,C81,C82,C83,C87,C9,D1,D2,D3,D5,D7,D8
`Chr4:33643690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B138,B91,C76
`Chr4:33643692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:33643722`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	98	A11,A14,A16,A21,A22,A3,A5,A9,B1,B105,B106,B115,B117,B118,B121,B122,B126,B129,B13,B130,B133,B137,B21,B26,B27,B30,B41,B42,B43,B44,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B58,B59,B60,B61,B7,B70,B72,B76,B78,B79,B8,B81,B84,B86,B87,B89,B94,B95,C1,C14,C17,C19,C22,C25,C26,C29,C30,C34,C35,C37,C39,C41,C45,C46,C48,C49,C52,C53,C57,C58,C59,C60,C61,C65,C67,C70,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,D11,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808857.1

151 aa

151

rve

PF00665 rve 7-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808857.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	7	105	3.2e-16	60.1	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952874.1
ATGGGAACCATGTACGCCACCTGTCCCTTCGACAAGTGGGGAATTGATATAGTGGGAAAACTCCCTACTGCACCTGGAGGAAAATGTTTCCTCATTGTAGCAGTCGATTATTTCTCCAAATTGGTGGAGGCCAAGGCAGTGTCAAAAATCGATGAATGCACTATCGAGAGATTCTTGTGGCGGAATATTTGTTGTAGATACGGGTCGCCGAGGGTACTCGTCTCTAACAATGGATCACAGTTCACCGGAAAAAGAATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023330
ATGGGAACCATGTACGCCACCTGTCCCTTCGACAAGTGGGGAATTGATATAGTGGGAAAACTCCCTACTGCACCTGGAGGAAAATGTTTCCTCATTGTAGCAGTCGATTATTTCTCCAAATTGGTGGAGGCCAAGGCAGTGTCAAAAATCGATGAATGCACTATCGAGAGATTCTTGTGGCGGAATATTTGTTGTAGATACGGGTCGCCGAGGGTACTCGTCTCTAACAATGGATCACAGTTCACCGGAAAAAGAATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808857.1
MGTMYATCPFDKWGIDIVGKLPTAPGGKCFLIVAVDYFSKLVEAKAVSKIDECTIERFLWRNICCRYGSPRVLVSNNGSQFTGKRIEEFCHRMDIIQRFISVAHPQANGHVELTNRTICEGLKSDWKKVNGDVRKSWMVFCGLIEPAQKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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