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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002116`

染色体: Chr04 坐标: 34159178-34160247 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002116`
名称	SmilChr04G002116
描述	uncharacterized SmilChr04G002116
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34159178 - 34160247 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023339`
GeneID	`131023339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023339`
原始查询	`LOC131023339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741]; symbol=HTB9; hit=AT3G45980; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741]; symbol=HTB9; hit=AT3G45980; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G45980` (HTB9) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823741] identity=62.5; qcov=0.249; evalue=5.96e-07; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808864.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808864.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057808864.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808864.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34159268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C5
`Chr4:34159274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C62
`Chr4:34159290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C25,C29,C5
`Chr4:34159303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C71
`Chr4:34159339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:34159343`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A4,B101,B113,B13,B131,B137,B15,B24,B32,B39,B64,B71,B82,C1,C15,C22,C42,C45,C47,C49,C54,C62,C67,C74,C76,D3
`Chr4:34159370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:34159417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B41,B75
`Chr4:34159417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B75
`Chr4:34159453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C37
`Chr4:34159465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B41,B69,D7
`Chr4:34159480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A1,A23,A24,A7,B102,B103,B11,B127,B15,B27,B30,B37,B40,B41,B44,B46,B48,B5,B52,B53,B60,B61,B65,B66,B71,B72,B76,B8,B81,B85,B88,B89,C12,C15,C21,C25,C26,C29,C5,C56,C57,C6,C64,C65,C66,C82,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952881.1
ATGGCAGCCAAAGGAGAGAAGAAGCTTGCCGAGAAGAAATCCGCCGCCGAGAAATCTCCGGCGGAGAAGAAGCCCAGGGCCGGGAAGAAGCTACCGAAGGAGGCCGGCGAGGGGCCCCGCGCCTGGTGCGCACAGGGCCTCCGCCTAGCACTGGAATCGCGAGTAGACAAATGCGTCTATCATCTGTTCGAGACTAACTGCAACAAGAGAAAGGGACCAGAAATTACGTCCTATTCTCAGAATTCCTCACTGCCCCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023339
ATGGCAGCCAAAGGAGAGAAGAAGCTTGCCGAGAAGAAATCCGCCGCCGAGAAATCTCCGGCGGAGAAGAAGCCCAGGGCCGGGAAGAAGCTACCGAAGGAGGCCGGCGAGGGGCCCCGCGCCTGGTGCGCACAGGGCCTCCGCCTAGCACTGGAATCGCGAGTAGACAAATGCGTCTATCATCTGTTCGAGACTAACTGCAACAAGAGAAAGGGACCAGAAATTACGTCCTATTCTCAGAATTCCTCACTGCCCCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808864.1
MAAKGEKKLAEKKSAAEKSPAEKKPRAGKKLPKEAGEGPRAWCAQGLRLALESRVDKCVYHLFETNCNKRKGPEITSYSQNSSLPQNARSPSPQNDSPAQKIEVLNSTNATNSPQKSAVNQTSSVETEVSKQNQSQIQNKVKVLKPNQITIPATKPPEPANPTANLPLEPRTSLQMVKRELRKRVCPRISLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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