当前解析结果
SmilChr04G002153| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002153 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002153 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002153 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 34577206 - 34577967 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023348 |
|---|---|
| GeneID | 131023348 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023348 |
| 原始查询 | LOC131023348 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023348 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057808872.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808872.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808872.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808872.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808872.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:34577347 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C1,C72,D4 |
Chr4:34577364 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr4:34577387 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A23,B136,B69,C24,C63,C76,C81,D1 |
Chr4:34577392 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr4:34577436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,C14 |
Chr4:34577503 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A20,A24,B1,B120,B123,B14,B19,B25,B53,B63,B97,C2,C36,C50,D5 |
Chr4:34577574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B41,B65,C11,C69 |
Chr4:34577583 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 19 | A20,A24,A3,B1,B120,B123,B137,B14,B19,B25,B53,B63,B80,B97,C2,C36,C41,C50,D5 |
Chr4:34577640 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr4:34577905 |
A |
AC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr4:34577905 |
A |
AC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:34577909 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。