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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002098`

染色体: Chr01 坐标: 37024229-37028094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002098`
名称	SmilChr01G002098
描述	nuclear transport factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37024229 - 37028094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023362`
GeneID	`131023362`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023362`
原始查询	`LOC131023362`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transport factor 2-like
产物	nuclear transport factor 2-like
Arabidopsis	`AT3G25150` (AT3G25150) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822106] identity=48.2; qcov=0.885; evalue=2.66e-108; confidence=high
Rice	`Os02g0497700` - identity=47; qcov=1; evalue=1.52e-107; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF02136 (NTF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023362

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808888.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808888.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057808888.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057808888.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057808888.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37024731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:37024913`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr1:37024913`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68
`Chr1:37024944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C2,C53,C59
`Chr1:37025313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:37025426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C2,C53,C59
`Chr1:37025543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B78,C18
`Chr1:37025691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:37025733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:37025735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C50,C64,C66,C70
`Chr1:37025880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:37026136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B125,B87,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808888.1

471 aa

236

471

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 18-134 aa PF00076 RRM_1 299-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808888.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	18	134	3.7e-32	111.9	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057808888.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	299	357	1.1e-12	48.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952905.1
ACTAATCATAATTTAATAACGTACTTAAAAAATATTGTTATATATCACGCAAAGATTTCCCTCTCTCTTTCTCTTCCATTTATAATAAATCATCAGAAACCCTTCTTCTCTCTCCATACTGCCCGCGCTCGCGCCTCTTCGAGATCCACCGCTGCGCCTCCTTTTACGTCGTCCAAACCCTAGATTCCGTCGCCGGGGCTGCGGCGGCTTTTCAGCGCTCCAAGGGAAGCTTCGGGGTAGAGAGAGTTCCGAAAAATCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023362
ATGGCGGCGGCAGCAGAGGTAGCAGCACAGCCACCAGTTACTGCCGAAGTTGTTGGGAACGCATTTGTGACTCAGTATTATCACATTCTGCATCTCTCGCCGGGGCTTGTTCATCGGTTTTATCAGGACGTAAGTAAGCTTGGTCGGCCAGAAGAGGATGGCTCCATGACCATCACCACCACTATGCAAGCCATAAATGAGAAGATTCTTGCCCTCAACTATGGTGATTTCAGAGCAGAGATCAAGTCAGTAGATTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808888.1
MAAAAEVAAQPPVTAEVVGNAFVTQYYHILHLSPGLVHRFYQDVSKLGRPEEDGSMTITTTMQAINEKILALNYGDFRAEIKSVDSQESFSGGVNVLVTGYMTAKDNSGRNFAQSFFLAPQDKGYFVLNDMFRYLDSSPSYPAVVNENVALTSPEPVPAAPTTVPENNVPASENKTPPAEEDVVEEVCNPSENGDVPIVEEEVPVAEVVDEVEDDTQMIVESSAKIEELPKKSYASIVMHLKESVASSPPPQVAPRKAPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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