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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002279`

染色体: Chr04 坐标: 37035361-37036575 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002279`
名称	SmilChr04G002279
描述	uncharacterized SmilChr04G002279
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37035361 - 37036575 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023382`
GeneID	`131023382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023382`
原始查询	`LOC131023382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=41.5; qcov=0.756; evalue=2.66e-49; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=42.2; qcov=1.12; evalue=7.71e-99; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808904.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808904.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808904.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808904.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37035387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B19,C18
`Chr4:37035408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B55,C29,C7,C9
`Chr4:37035419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B53,C72,C82,D4
`Chr4:37035434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:37035440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr4:37035461`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B42,B48
`Chr4:37035461`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B48
`Chr4:37035468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C17,C40
`Chr4:37035565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B53,C72,D4
`Chr4:37035571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D7
`Chr4:37035594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B5,C39
`Chr4:37035627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B20,C65,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808904.1

348 aa

174

348

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-190 aa PF04827 Plant_tran 191-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808904.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	4.4e-20	71.9	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057808904.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	190	4.7e-51	174.0	Plant transposon protein
`XP_057808904.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	191	281	4.7e-51	174.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952921.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAAATCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023382
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAAATCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808904.1
MTVASSYRFDPPPPRPRKKRTVVRRDREGGAERLHRDYFSVEPVYGPQIFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTAADCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRWPTTADVQRIIAMHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHSAYTRGDQVAGSNNNINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTQGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFSNDEKKQRFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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