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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002288`

染色体: Chr04 坐标: 37169936-37171128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002288`
名称	SmilChr04G002288
描述	uncharacterized SmilChr04G002288
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37169936 - 37171128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023384`
GeneID	`131023384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023384`
原始查询	`LOC131023384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.6; qcov=0.737; evalue=3.9e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=30.4; qcov=0.927; evalue=1.72e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808906.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808906.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808906.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808906.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37169969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B21,B7
`Chr4:37170073`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B24,B65,B68,B93,C1
`Chr4:37170073`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B24,B65,B68,B93,C1
`Chr4:37170085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B68,C13,C3,D11
`Chr4:37170091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr4:37170093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B67,C7,D5
`Chr4:37170112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr4:37170124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B134,D10
`Chr4:37170130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr4:37170145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B120,B22
`Chr4:37170197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B44,B66
`Chr4:37170206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952923.1
ATGGTAGCCCATCAGGTGAGTTTCATTTGGAAAGGGGCCTCAGACAAGGCGAGCCTGTCACCTTTCCTCTTCCTGATTGTAGCGAAAGGACTTAATTTGATCACCAATAGAGCCATTCATCAAAGGCTGCTGGAACCGTTTGTTTTCAGGAGCAACGGTCTTTCTGTCTCACACTTGCAGTATGCAGACGATACGGTTTTTGTGGCCTCCGGGAAAAGTGAAAATGCCTGGGTTCTCAAGAGTATCCTGAAAATTTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023384
ATGGTAGCCCATCAGGTGAGTTTCATTTGGAAAGGGGCCTCAGACAAGGCGAGCCTGTCACCTTTCCTCTTCCTGATTGTAGCGAAAGGACTTAATTTGATCACCAATAGAGCCATTCATCAAAGGCTGCTGGAACCGTTTGTTTTCAGGAGCAACGGTCTTTCTGTCTCACACTTGCAGTATGCAGACGATACGGTTTTTGTGGCCTCCGGGAAAAGTGAAAATGCCTGGGTTCTCAAGAGTATCCTGAAAATTTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808906.1
MVAHQVSFIWKGASDKASLSPFLFLIVAKGLNLITNRAIHQRLLEPFVFRSNGLSVSHLQYADDTVFVASGKSENAWVLKSILKIFEALSGLKVNFDKSNIFGIGVPSPLRVQMANTLNCQVGEFPTKFLGILIGARLSRVAEWSYLVEKIKRKIKFWQNRKLSFAGRITLLRSSDEWVFVGGEGTEGRKIHWVKWEDLGEDVREGGLGIKDLESFNKALMAKWIWRLLTERESFWVRVVQASKGEIGWDGEGLCFEKKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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