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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002319`

染色体: Chr04 坐标: 37485007-37488368 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002319`
名称	SmilChr04G002319
描述	uncharacterized SmilChr04G002319
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37485007 - 37488368 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023391`
GeneID	`131023391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023391`
原始查询	`LOC131023391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=38.9; qcov=0.165; evalue=5.47e-28; confidence=weak
Rice	`Os04g0191000` - identity=40.6; qcov=0.596; evalue=8.66e-115; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808913.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808913.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808913.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057808913.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057808913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808913.1

904 aa

452

904

zf-CCHC

RVP_2

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF00098 zf-CCHC 224-240 aa PF08284 RVP_2 326-360 aa PF00078 RVT_1 460-617 aa PF17919 RT_RNaseH_2 680-772 aa PF17917 RT_RNaseH 707-804 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808913.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	224	240	9.6e-06	26.2	Zinc knuckle
`XP_057808913.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	326	360	1e-06	29.3	Retroviral aspartyl protease
`XP_057808913.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	460	617	4.5e-37	128.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057808913.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	680	772	2.1e-32	111.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057808913.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	707	804	2.5e-33	115.1	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952930.1
ATGTGCGTGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTATTGGTGGGAAGCAAAGCAGAAAACTATGACCCCGGAGCAGTTAGATGAACTCACTTGGGAGCTTTTTAAGACTGCTCTATGTGAGAAGTTCATACCCAGAAGCTATAGGAAAAAGAAGGAGATGGAGTTTACCACCTTAAAGCAAGGGAATAAAACTGTAGTGGAGTACGATCGACTATTCTGCGATCTGGCCCGATATGCACCGTATAGAGTGGATACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023391
ATGTGCGTGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTATTGGTGGGAAGCAAAGCAGAAAACTATGACCCCGGAGCAGTTAGATGAACTCACTTGGGAGCTTTTTAAGACTGCTCTATGTGAGAAGTTCATACCCAGAAGCTATAGGAAAAAGAAGGAGATGGAGTTTACCACCTTAAAGCAAGGGAATAAAACTGTAGTGGAGTACGATCGACTATTCTGCGATCTGGCCCGATATGCACCGTATAGAGTGGATACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808913.1
MCVSYQLKGTADYWWEAKQKTMTPEQLDELTWELFKTALCEKFIPRSYRKKKEMEFTTLKQGNKTVVEYDRLFCDLARYAPYRVDTDEKMSELFCAGLRQEIRVVLASQTALSYAEALNRALDMELAMQPEKTTHTPTPPSAQYTQVSNTPYSNQGQKGKRKWENRGNEGKKPWQGQNVQAPFVKGDKLFYGGPATSHPGHQGIPPCPKCNKLHTGVCRAGNPNCFTCGKPGHYSSQCPNRQQGMSGGRPNQFPTPQLRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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