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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002334`

染色体: Chr04 坐标: 37674037-37674732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002334`
名称	SmilChr04G002334
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37674037 - 37674732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023394`
GeneID	`131023394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023394`
原始查询	`LOC131023394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
产物	secreted RxLR effector protein 161-like
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=36.3; qcov=0.775; evalue=1.5e-27; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=39; qcov=0.965; evalue=2.56e-39; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808917.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808917.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808917.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808917.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37674048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:37674116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B36
`Chr4:37674141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A13,B131,B49,C27
`Chr4:37674192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C37,C56,C67
`Chr4:37674278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B77,B78,C77,D10
`Chr4:37674282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B77,B78,C77,D10
`Chr4:37674301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A14,A15,A7,B107,B133,B137,B140,B19,B23,B32,B49,B50,B59,B65,B70,B79,B86,B88,B9,B99,C25,C34,C40,C43,C45,C52,C54,C64,C65,C70,C72,C81
`Chr4:37674321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:37674335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B2,C62,C85
`Chr4:37674354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B46,B94,C87
`Chr4:37674358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A1,B131,B9,C27,C53,C67
`Chr4:37674371`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952934.1
ATGAAAATGATCCCATATGCTTCTTCTATAGGATCGATAATGTATGTCATGACATCTACTAGGCCAGATGTGGCATATGCGCTTAGCATGACAAGCAGATTTCAGCAAAATCCCGGTGAGGTACATTGGAGAACTGTCAAGACTATTCTAAAGTACCTTAGAAGGACTAAAGAATACTTCTTAGTCTATGGTGGACAGCCAGAGTTATCAGTTACTGGGTATACTGATGCTAGCTTCCAAACAGACCATGATGACTATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023394
ATGAAAATGATCCCATATGCTTCTTCTATAGGATCGATAATGTATGTCATGACATCTACTAGGCCAGATGTGGCATATGCGCTTAGCATGACAAGCAGATTTCAGCAAAATCCCGGTGAGGTACATTGGAGAACTGTCAAGACTATTCTAAAGTACCTTAGAAGGACTAAAGAATACTTCTTAGTCTATGGTGGACAGCCAGAGTTATCAGTTACTGGGTATACTGATGCTAGCTTCCAAACAGACCATGATGACTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808917.1
MKMIPYASSIGSIMYVMTSTRPDVAYALSMTSRFQQNPGEVHWRTVKTILKYLRRTKEYFLVYGGQPELSVTGYTDASFQTDHDDYKSQSGYVFILNGGAVSWNSSKQSTTADSTTEAEYIAASEAAKEAVALLEFVKELGVIPSTNCAIPLYCDNTGAVAQAKEPRPTNRNKHIPRRYHLIREIIERGDVRLERVPTDDNLADPFTKPLCISKHNKHFEGLGVRHVGSWL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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