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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002375`

染色体: Chr04 坐标: 38253155-38253961 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002375`
名称	SmilChr04G002375
描述	uncharacterized SmilChr04G002375
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38253155 - 38253961 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023404`
GeneID	`131023404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023404`
原始查询	`LOC131023404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0604E01.25; symbol=P0604E01.25; hit=Os08g0561000; species=rice; confidence=low
产物	P0604E01.25; symbol=P0604E01.25; hit=Os08g0561000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0561000` (P0604E01.25) - identity=30; qcov=0.597; evalue=1.77e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808927.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808927.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808927.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808927.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38253168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C21,C29,D10
`Chr4:38253174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:38253191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A18,B139,C18,C22
`Chr4:38253197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	125	A1,A14,A16,A18,A21,A23,A3,A5,A7,B1,B10,B100,B102,B103,B108,B111,B112,B113,B117,B119,B120,B121,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B17,B19,B2,B26,B27,B29,B33,B35,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B72,B75,B76,B8,B80,B83,B84,B89,B91,B94,B96,C1,C11,C12,C13,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C35,C37,C40,C41,C42,C47,C49,C5,C55,C56,C57,C59,C63,C69,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C79,C84,C86,C9,D1,D10,D2,D7
`Chr4:38253209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	126	A11,A13,A15,A18,A19,A20,A21,A22,A24,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B11,B110,B115,B118,B120,B122,B123,B125,B126,B128,B130,B131,B132,B133,B137,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B41,B49,B50,B51,B52,B55,B59,B62,B63,B65,B66,B70,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B82,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B99,C15,C17,C19,C2,C20,C21,C23,C25,C30,C31,C34,C35,C36,C39,C43,C44,C45,C46,C51,C52,C53,C54,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C65,C67,C70,C71,C72,C74,C80,C83,C86,C87,D1,D11,D5,D6
`Chr4:38253236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B1,B54,B91,C35
`Chr4:38253248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:38253296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:38253331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B79,C50,C8
`Chr4:38253371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:38253385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:38253396`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952944.1
ATGACCTTCAAAGAGAAGGCACCGACTCCTATGCCGGAGGAAGGAAGGACCTCTCATCACACCTACACCCCCGAGGAGACGGACCTTATTGTCCGAGTTTGGACAGAGGAGACCAACGACGCCATCCGGGGTGTCGACCAGAAGGGAGAGGCCTATTGGCAACGGATTCTTGATCGGATGAACCCCCTCATCGGCGCCAACCTCAAACACCGCCAAATAAAGGGACACTGGGCTCGAGTAAATGCGGAGGTGAAGTTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023404
ATGACCTTCAAAGAGAAGGCACCGACTCCTATGCCGGAGGAAGGAAGGACCTCTCATCACACCTACACCCCCGAGGAGACGGACCTTATTGTCCGAGTTTGGACAGAGGAGACCAACGACGCCATCCGGGGTGTCGACCAGAAGGGAGAGGCCTATTGGCAACGGATTCTTGATCGGATGAACCCCCTCATCGGCGCCAACCTCAAACACCGCCAAATAAAGGGACACTGGGCTCGAGTAAATGCGGAGGTGAAGTTATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808927.1
MTFKEKAPTPMPEEGRTSHHTYTPEETDLIVRVWTEETNDAIRGVDQKGEAYWQRILDRMNPLIGANLKHRQIKGHWARVNAEVKLWENIWVETCAKWPFGHSADMLQQKAQTIFAARSTSGPFTYWNAWKMLQTNRRFKSMYIEGDVHASKRTKTSEMGDFTTSGSGEEITSSRPIGNKAARAVKGKGKSSALQASEAPPETKEMFEKFDNKITRIMEMYDQKNALKREIHDDRVIFMKTSDMTPEQLEWHKEWVTEIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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