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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002513`

染色体: Chr04 坐标: 40127188-40128867 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002513`
名称	SmilChr04G002513
描述	uncharacterized SmilChr04G002513
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40127188 - 40128867 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023427`
GeneID	`131023427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023427`
原始查询	`LOC131023427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=30.2; qcov=0.326; evalue=1.17e-23; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=22.3; qcov=0.385; evalue=1.81e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808950.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808950.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808950.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057808950.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057808950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40127196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:40127674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:40127677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B23,B24,C22
`Chr4:40127685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B9
`Chr4:40127690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B63
`Chr4:40127750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:40127753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:40127788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:40127998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr4:40128027`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr4:40128027`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B20
`Chr4:40128073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B30,B99,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952967.1
ATGCGTCTGCCTCCCAGGGAGTCGGGTACTGATTCGGACGCGGTTGCCGTCGGAATGCGATCTACTGGTAATTCTTCAAATCTGACAGATAACCAACCCACCCAGATTCTCACTTATTCCGACATCGTTAGCATCTCCCCTAAGAATAGAGTTTCTTATGCGGAGGCTACTGGCAAGAAGTCGGTGAAAATACAGGATTTGGCTGCTCACATTTTTCATGATCTGCGGCCTACTAAGGAGGGCGATCAGTTCTCCCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023427
ATGCGTCTGCCTCCCAGGGAGTCGGGTACTGATTCGGACGCGGTTGCCGTCGGAATGCGATCTACTGGTAATTCTTCAAATCTGACAGATAACCAACCCACCCAGATTCTCACTTATTCCGACATCGTTAGCATCTCCCCTAAGAATAGAGTTTCTTATGCGGAGGCTACTGGCAAGAAGTCGGTGAAAATACAGGATTTGGCTGCTCACATTTTTCATGATCTGCGGCCTACTAAGGAGGGCGATCAGTTCTCCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808950.1
MRLPPRESGTDSDAVAVGMRSTGNSSNLTDNQPTQILTYSDIVSISPKNRVSYAEATGKKSVKIQDLAAHIFHDLRPTKEGDQFSLKIPKDLYLEEIKAFEFALTGRLFLQKGDKPRSTMELKWELQRLWSLASDWQLIPLGKGFFTLRFTTAEDKATTKGKAVWELSKGLLRLREWTRNFDPFKENSPLADVWVRIHYLPIEYWNPQVISGIGRYLGHPLKIDGASARRDFGQFARILVEIDMSQNLPSTLLIDGEDTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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