当前解析结果
SmilChr04G002538| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002538 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002538 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002538 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 40618381 - 40620767 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023435 |
|---|---|
| GeneID | 131023435 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023435 |
| 原始查询 | LOC131023435 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023435 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808958.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808958.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808958.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808958.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808958.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:40618492 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B12,B130,B2,B20,B67,B68,B94,C53,C79 |
Chr4:40618508 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 46 | A10,A14,A2,A21,A3,A7,A9,B1,B10,B103,B115,B122,B125,B129,B13,B135,B137,B140,B17,B24,B28,B34,B40,B79,B80,B83,B84,B85,B94,C11,C12,C13,C20,C21,C32,C33,C37,C50,C53,C58,C6,C68,C69,C83,C87,C9 |
Chr4:40618509 |
G |
GGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B4,B61 |
Chr4:40618509 |
G |
GGA |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B4,B61 |
Chr4:40618513 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C83 |
Chr4:40618513 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr4:40618538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A10,A7,B135,B137,B40,C33 |
Chr4:40618587 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B130,B2,B20,B67,C53,C79 |
Chr4:40618635 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B139,B94,C8,D6 |
Chr4:40618661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B106,C36,C64,C67 |
Chr4:40618668 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B50,B66,B82 |
Chr4:40618670 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B50,B66,B82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。