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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002540`

染色体: Chr04 坐标: 40667897-40668488 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002540`
名称	SmilChr04G002540
描述	transcription factor TGA2.2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40667897 - 40668488 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023437`
GeneID	`131023437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023437`
原始查询	`LOC131023437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TGA2.2-like
产物	transcription factor TGA2.2-like
Arabidopsis	`AT1G68640` (PAN) bZIP transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843194] identity=52.1; qcov=0.712; evalue=4.68e-25; confidence=medium
Rice	`Os03g0318600` (OsbZIP28) transcription factor TGA2.2-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4332660] identity=53.8; qcov=0.776; evalue=2.73e-29; confidence=medium
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808961.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808961.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057808961.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808961.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40667902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B59,C81
`Chr4:40667902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:40667908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B135,C37,C77
`Chr4:40667911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:40667918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B124,B135,C37,C77
`Chr4:40667918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B135,C37,C77
`Chr4:40667923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:40667924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B135,C37,C77
`Chr4:40667925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B129,B62,B89,C26
`Chr4:40667951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A1,B139,B59,C18,C22,C27,C81
`Chr4:40667952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,D11,D2
`Chr4:40667972`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952978.1
ATGTGGCGTCGCAGCCCGGTGCAAACGGCGACGACGACGGCCCCAACACGGCAGCGAGAGGATCTTCGTGTTCACGATGAATCACATCGAGAAGCTCGATCCGACATTGCTGAGGTGCGGGAGAATGAACATGCACATCCATATGAGCTACTGCTAGTTTTCGGCACTCAAAATTCTGTTGAAGAATTATTTAGGATACGAGGAGAGCGACCTGGAGATGGAGGCGGTGGAGGAATTCTCAGCGGTGATCGACGCAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023437
ATGTGGCGTCGCAGCCCGGTGCAAACGGCGACGACGACGGCCCCAACACGGCAGCGAGAGGATCTTCGTGTTCACGATGAATCACATCGAGAAGCTCGATCCGACATTGCTGAGGTGCGGGAGAATGAACATGCACATCCATATGAGCTACTGCTAGTTTTCGGCACTCAAAATTCTGTTGAAGAATTATTTAGGATACGAGGAGAGCGACCTGGAGATGGAGGCGGTGGAGGAATTCTCAGCGGTGATCGACGCAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808961.1
MWRRSPVQTATTTAPTRQREDLRVHDESHREARSDIAEVRENEHAHPYELLLVFGTQNSVEELFRIRGERPGDGGGGGILSGDRRSGDDADRYIYIPLILWIGGFRPSELLKILVSQLEPLTEQQLPGICNLQQSSNQAEYALSQGMEALQQSLAETLASGSSANVVRGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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