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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002553`

染色体: Chr04 坐标: 40830663-40831283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002553`
名称	SmilChr04G002553
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40830663 - 40831283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023439`
GeneID	`131023439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023439`
原始查询	`LOC131023439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=34.8; qcov=0.893; evalue=2.27e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=31; qcov=0.767; evalue=1.22e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808963.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808963.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40830708`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:40830708`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:40830730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C4,C40,C44
`Chr4:40830731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:40830745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B59,B86,C81
`Chr4:40830753`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B59,C81
`Chr4:40830753`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:40830754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B104,B68,C40,C82
`Chr4:40830754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B68,C40,C82
`Chr4:40830819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:40830822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B1,B7,B75,B90,C1,C54,C79
`Chr4:40830823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952980.1
ATGTGGAATAAGATCCAAAGTTGGCAGGGCAAAAAGCTTTCAAAAGCCGGGAAGGAGATCTTAATTAAAGCTGTAGTGCAGGAAATACCTTCTTATTGCATGGCTATCTTCTCTCTACCTACCAGTTTGACTGATGAAATGGAAAGGCTCATGAATAGTTTTTCGTGGAGTAACAAGGGTGGATCGAGCCGGGGGATAAACTGGATGAAATGGGACCGGATCTGTGTGGACAAGAAGCTAGGTGGATTGGGTTTTAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023439
ATGTGGAATAAGATCCAAAGTTGGCAGGGCAAAAAGCTTTCAAAAGCCGGGAAGGAGATCTTAATTAAAGCTGTAGTGCAGGAAATACCTTCTTATTGCATGGCTATCTTCTCTCTACCTACCAGTTTGACTGATGAAATGGAAAGGCTCATGAATAGTTTTTCGTGGAGTAACAAGGGTGGATCGAGCCGGGGGATAAACTGGATGAAATGGGACCGGATCTGTGTGGACAAGAAGCTAGGTGGATTGGGTTTTAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808963.1
MWNKIQSWQGKKLSKAGKEILIKAVVQEIPSYCMAIFSLPTSLTDEMERLMNSFSWSNKGGSSRGINWMKWDRICVDKKLGGLGFRSLQLLNLALLGKMGWTLLEDPDALFCKVLKAKYFPNGNFLTAPVGHSPSFTWRSICSAQELVRRGVRWRIGNGMNVRVFDGPWLRRDDSFWVSSPCPSGFAGLRVCDLMSPDSNNWDLDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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