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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002556`

染色体: Chr04 坐标: 40871294-40872550 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002556`
名称	SmilChr04G002556
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	40871294 - 40872550 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023440`
GeneID	`131023440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023440`
原始查询	`LOC131023440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT1G11620` (AT1G11620) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837706] identity=28.8; qcov=0.615; evalue=1.54e-17; confidence=low
Rice	`Os05g0177400` (OsFbox253) - identity=26.5; qcov=0.804; evalue=5.87e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like); PF24750 (b-prop_At3g26010-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808964.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808964.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808964.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808964.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:40871329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C40,C81
`Chr4:40871341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A22,C4,C49
`Chr4:40871413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:40871585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr4:40872122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:40872336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:40872347`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr4:40872347`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr4:40872436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:40872500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:40872542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808964.1

418 aa

209

418

F-box-like

F-box

FBA_3

b-prop_At3g26010-like

FBA_1

PF12937 F-box-like 25-61 aa PF00646 F-box 26-64 aa PF08268 FBA_3 101-306 aa PF24750 b-prop_At3g26010-like 111-312 aa PF07734 FBA_1 112-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808964.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	25	61	2.7e-08	34.2	F-box-like
`XP_057808964.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	26	64	4.6e-09	36.5	F-box domain
`XP_057808964.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	101	306	1.7e-10	41.2	F-box associated beta propeller domain
`XP_057808964.1`	Pfam	`PF24750`	b-prop_At3g26010-like	Repeat	111	312	2.7e-06	27.5	F-box protein At3g26010-like, beta-propeller
`XP_057808964.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	112	260	8.5e-20	71.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952981.1
ATGCCTCCCAAGAGAAACTCAAAATCCCACAACAAGAACAAGGCAGCGGCGGAGACGAACGCCATGGGCGACTGCAAGTTACCTCCGGACATGATGATCGCCATTTTGGCGCGACTACCGGTGAAATCTCTGTGCCGCTTCAAGTGCGTATGCAAGCCGTGGTGCAAGCTCGTCTCGAATCCAGATTTCGTAAAGCTTCACACCGATCTGTCCCCGAGAGCGAGAGCCTCCGCCTCCGTTGTTCAGTCGCATCTCCTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023440
ATGCCTCCCAAGAGAAACTCAAAATCCCACAACAAGAACAAGGCAGCGGCGGAGACGAACGCCATGGGCGACTGCAAGTTACCTCCGGACATGATGATCGCCATTTTGGCGCGACTACCGGTGAAATCTCTGTGCCGCTTCAAGTGCGTATGCAAGCCGTGGTGCAAGCTCGTCTCGAATCCAGATTTCGTAAAGCTTCACACCGATCTGTCCCCGAGAGCGAGAGCCTCCGCCTCCGTTGTTCAGTCGCATCTCCTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808964.1
MPPKRNSKSHNKNKAAAETNAMGDCKLPPDMMIAILARLPVKSLCRFKCVCKPWCKLVSNPDFVKLHTDLSPRARASASVVQSHLLTCSVLGINPNRVSPIEADHPYEIFLDHCNGLVCMGRPAFTDKVILWNPATNLWKVLPGFRTNFGATKMVSLGFGCTAEGDDFKVVRISCLKGKKMKVGVEVYSSKSASWRVLDDVGIRCRVKYPKNHVIVNGDPYWDTCFAERLNQNGEIEEASALLGFDATHMKFKVVPLPRY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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