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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002647`

染色体: Chr04 坐标: 41828382-41832078 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002647`
名称	SmilChr04G002647
描述	uncharacterized SmilChr04G002647
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41828382 - 41832078 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023456`
GeneID	`131023456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023456`
原始查询	`LOC131023456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=28.1; qcov=0.377; evalue=1.44e-42; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26; qcov=0.648; evalue=5.98e-61; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808979.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808979.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808979.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808979.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:41828403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B122,D10
`Chr4:41828403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D10
`Chr4:41828419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:41828421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:41828436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B98,C32,C68
`Chr4:41828459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B124,B6,B88
`Chr4:41828480`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A14,A15,A2,A20,A25,A7,A8,A9,B100,B103,B104,B105,B107,B115,B136,B14,B15,B17,B2,B20,B25,B3,B35,B37,B41,B48,B53,B55,B63,B66,B72,B82,B86,B88,B90,B91,B98,B99,C11,C14,C16,C28,C3,C33,C4,C42,C43,C49,C50,C52,C56,C57,C59,C61,C64,C65,C69,C71,C77,C83,C84,D11,D3,D9
`Chr4:41828505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B124,B88,C67
`Chr4:41828505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B88,C67
`Chr4:41828506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B6,C47
`Chr4:41828530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B6,C47,D10
`Chr4:41828531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808979.1

1078 aa

539

1078

RVT_1

PF00078 RVT_1 843-957 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808979.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	843	957	6.2e-20	72.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952996.1
ATGGAGTTGAAAAACGAACTTCAGAACATGTGGAAACCGGAGAGCAAATGGCAACTTATACCTATGAGTAAGGGTTTCTACACTATCAAATTTACTACTGCGGAAGATAAAAACTGTGCTAAGCGATCCAACATGTGGAACTTGAACTCGGGCACTATGCGGCTACGTGAATGGGTGAGAAATTTTGACCCTTATAAAGAAATCTCCTCACTATGCCAAGTGTGGGTGCGTATTTATTACTTACCTGTGGAGTATTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023456
ATGGAGTTGAAAAACGAACTTCAGAACATGTGGAAACCGGAGAGCAAATGGCAACTTATACCTATGAGTAAGGGTTTCTACACTATCAAATTTACTACTGCGGAAGATAAAAACTGTGCTAAGCGATCCAACATGTGGAACTTGAACTCGGGCACTATGCGGCTACGTGAATGGGTGAGAAATTTTGACCCTTATAAAGAAATCTCCTCACTATGCCAAGTGTGGGTGCGTATTTATTACTTACCTGTGGAGTATTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808979.1
MELKNELQNMWKPESKWQLIPMSKGFYTIKFTTAEDKNCAKRSNMWNLNSGTMRLREWVRNFDPYKEISSLCQVWVRIYYLPVEYWTKEIISSIGRSVGMPIKVDGATVDGDFAHFARVLVEVDLALPLPESAAIECPDRTFHCKKKNSNTKGKGPEVDRNKEVEGVSKDAAKDAEKNSGAEFSVVKSKSTWAAKPMVERDDRGKVESVNRFNALSNMIENVEEMSGPDLLEAVTIPVTEKNVDAGRNVDSEEEDVEQIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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