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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002680`

染色体: Chr04 坐标: 42227092-42227546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002680`
名称	SmilChr04G002680
描述	peroxidase N-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42227092 - 42227546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023461`
GeneID	`131023461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023461`
原始查询	`LOC131023461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase N-like
产物	peroxidase N-like
Arabidopsis	`AT5G19890` (AT5G19890) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832111] identity=47.4; qcov=0.685; evalue=3.01e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0235000` (poxN) - identity=45; qcov=0.721; evalue=5.19e-16; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808985.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808985.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808985.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808985.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42227135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:42227395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59
`Chr4:42227399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59
`Chr4:42227418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B48,C45,D5
`Chr4:42227466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr4:42227498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808985.1

111 aa

111

peroxidase

PF00141 peroxidase 36-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808985.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	36	111	2e-11	44.9	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953002.1
ATGGATTTGAGGAAGTGGATGATCTCCAACCGCGAGTCGGCGCGGCGGAGCCGCCTCCAGAAGCATAAGCACATGGAGGAGCTGATGGCGCAGGTGGCCAATCGCGGCCACATGATCGGGTTATCAAGGTGCGCGCTCTTCAGCGGTAGATTGTCCAACTTCAACAGCAGCGGCGCGCCGGACGCGACGCTGGACAACAGCCTGATCCCGGAGCTCCGATCGGTGTGTCCCGTCAACGGCGACGGAAACAACATGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023461
ATGGATTTGAGGAAGTGGATGATCTCCAACCGCGAGTCGGCGCGGCGGAGCCGCCTCCAGAAGCATAAGCACATGGAGGAGCTGATGGCGCAGGTGGCCAATCGCGGCCACATGATCGGGTTATCAAGGTGCGCGCTCTTCAGCGGTAGATTGTCCAACTTCAACAGCAGCGGCGCGCCGGACGCGACGCTGGACAACAGCCTGATCCCGGAGCTCCGATCGGTGTGTCCCGTCAACGGCGACGGAAACAACATGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808985.1
MDLRKWMISNRESARRSRLQKHKHMEELMAQVANRGHMIGLSRCALFSGRLSNFNSSGAPDATLDNSLIPELRSVCPVNGDGNNMVALENRSRDPFDNSYFRNLVNGRGIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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