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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002737`

染色体: Chr04 坐标: 43044312-43045499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002737`
名称	SmilChr04G002737
描述	uncharacterized SmilChr04G002737
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	43044312 - 43045499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023475`
GeneID	`131023475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023475`
原始查询	`LOC131023475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.9; qcov=0.392; evalue=1.14e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=46.3; qcov=1.05; evalue=1.98e-114; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809000.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809000.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809000.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809000.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809000.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:43044379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:43044454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:43044485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:43044742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B89,C57,C83
`Chr4:43044762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B130
`Chr4:43044766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A8,C25,C56,C86
`Chr4:43044771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:43044781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C32
`Chr4:43044792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B65
`Chr4:43044803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:43044837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C43
`Chr4:43044842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809000.1

362 aa

181

362

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809000.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	7.9e-18	64.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057809000.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	304	5.1e-72	242.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953017.1
ATGCAAGTGGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGTGGCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTCTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTGGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCAGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023475
ATGCAAGTGGCAAGTTCATATCGGTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGACGAAAAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGTGGCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTGCCGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTCTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTGGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCAGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809000.1
MQVASSYRFDPPPPRPTKKRAVVRRDREGGGERLHRDYFAVEPVYGPQFFRRRFRMSREFFLRIVNALEVDPYFQQRQDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAAVRIFGGTYLRRPTTADVQRIAAMHEARHGFPRMLGSLDCMHWGWKNWPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLVGHEVAVHFLANNSHHTRGYYLTDDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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