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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002815`

染色体: Chr04 坐标: 44163489-44164437 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002815`
名称	SmilChr04G002815
描述	uncharacterized acetyltransferase At3g50280-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44163489 - 44164437 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023485`
GeneID	`131023485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023485`
原始查询	`LOC131023485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824192]; symbol=AT3G50300; hit=AT3G50300; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824192]; symbol=AT3G50300; hit=AT3G50300; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G50300` (AT3G50300) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824192] identity=42.6; qcov=0.957; evalue=8.31e-31; confidence=medium
Rice	`Os01g0854000` - identity=33.3; qcov=0.929; evalue=2.78e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809010.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057809010.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809010.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809010.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44163905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C24,C29
`Chr4:44163948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B74,B77,C74
`Chr4:44163951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C7
`Chr4:44163957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr4:44163963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B77,C74
`Chr4:44163969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B75,B77,C74
`Chr4:44163975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,A5,B8,C9
`Chr4:44163976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:44164006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D11
`Chr4:44164017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B82
`Chr4:44164053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B82
`Chr4:44164083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B28,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809010.1

184 aa

184

Transferase

PF02458 Transferase 8-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809010.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	8	175	4.6e-22	79.0	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953027.1
ATGGAATTACAACTTATACGAGCCGAGTTCACTCGTGCAGTCACCGCCTCCGTCACCGTCTCCGGCCTCCTCGGGCCGAGCTACACGGATATCGAGTCTTTGTTGTTCCCGATCAACACTGGCGTCCACAGTTACGAAGGAATCTCAAAGCCTCTATTGGCAGTGCAAGTCACGGAGCTCGACGACAGCATCTTCATCGACTCCGCCGCTAACCACGCCGCCGTGGACGGCGCTTCCTTCTGGCATTTCTTCAACTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023485
ATGGAATTACAACTTATACGAGCCGAGTTCACTCGTGCAGTCACCGCCTCCGTCACCGTCTCCGGCCTCCTCGGGCCGAGCTACACGGATATCGAGTCTTTGTTGTTCCCGATCAACACTGGCGTCCACAGTTACGAAGGAATCTCAAAGCCTCTATTGGCAGTGCAAGTCACGGAGCTCGACGACAGCATCTTCATCGACTCCGCCGCTAACCACGCCGCCGTGGACGGCGCTTCCTTCTGGCATTTCTTCAACTCTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809010.1
MELQLIRAEFTRAVTASVTVSGLLGPSYTDIESLLFPINTGVHSYEGISKPLLAVQVTELDDSIFIDSAANHAAVDGASFWHFFNSWSEISRGSESISKSPIFDRDRYNGAAAAVDNRLIHIPTLEKNLMAAPSQLVLQKVFHFNKEELSQLKAKANSEAGTDKISTLQALMAHLAEHGALSSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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