当前解析结果
SmilChr04G002824| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002824 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002824 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002824 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 44311592 - 44311990 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023488 |
|---|---|
| GeneID | 131023488 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023488 |
| 原始查询 | LOC131023488 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023488 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057809014.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057809014.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809014.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809014.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809014.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:44311598 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:44311606 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,C32,C65 |
Chr4:44311613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,C32,C65 |
Chr4:44311614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B130,B63,C53 |
Chr4:44311622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B68,C9 |
Chr4:44311702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B130,B63,C53 |
Chr4:44311713 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 47 | A11,A14,A22,A23,A7,A8,B104,B107,B111,B118,B123,B15,B18,B19,B2,B23,B25,B38,B39,B45,B56,B6,B61,B62,B69,B70,B78,B79,B91,B96,C14,C18,C21,C35,C40,C58,C62,C63,C65,C67,C71,C72,C76,C84,C87,D1,D2 |
Chr4:44311749 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B68,C9 |
Chr4:44311756 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr4:44311767 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr4:44311814 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B68,C9 |
Chr4:44311827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B107,B130,B63,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。