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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002842`

染色体: Chr04 坐标: 44557741-44559525 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002842`
名称	SmilChr04G002842
描述	uncharacterized SmilChr04G002842
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44557741 - 44559525 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023491`
GeneID	`131023491`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023491`
原始查询	`LOC131023491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=31.4; qcov=0.235; evalue=2.73e-12; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=41.7; qcov=0.31; evalue=7.4e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023491

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809017.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809017.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809017.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809017.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809017.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44557791`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B106,B12,B120,B123,C20,C32
`Chr4:44557803`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B106,B12,B120,B123,C20,C32
`Chr4:44557813`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B106,B12,B120,B123,C20,C32
`Chr4:44557817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B75
`Chr4:44557821`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,B103,B38,B39,B51,B53,B66,B72,B77,B8,B9,C10,C19,C31,C41,C59,C75,C83
`Chr4:44557823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A8,B122,B123,B128,B41,B73,C82,D6
`Chr4:44557836`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B51,B53,B66,B72,B8,B9,C10,C59,C83
`Chr4:44557842`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B106,B12,B120,B123
`Chr4:44557842`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B106,B12,B120,B123
`Chr4:44557847`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B106,B12,B120
`Chr4:44557847`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B106,B12,B120
`Chr4:44557861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B12,B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809017.1

503 aa

252

503

RVT_1

PF00078 RVT_1 413-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809017.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	413	503	9.8e-10	39.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953034.1
ATGAATGTTTTAGTCTGGAATGCTCGGGGGTTGGGGAGCTCCCGCGCATTCCATGAACTTCACCGGCTCATTGCTGGCACCTCCTCGAGTGTGCTGTTTATCAGTGAGATGAAAGTCACCGCGAAAAAGGCGTCTTGGTGGCGATCCTCTTTGCATTTCGATGGACAGCTCGTTGTGGATTCAAAAGGAGCTAGTGGTGGTTTGATGATCTTTTGGATAGATTCTTGTGTGCTTAATGTGTCCAGTTACTCTAATGGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023491
ATGAATGTTTTAGTCTGGAATGCTCGGGGGTTGGGGAGCTCCCGCGCATTCCATGAACTTCACCGGCTCATTGCTGGCACCTCCTCGAGTGTGCTGTTTATCAGTGAGATGAAAGTCACCGCGAAAAAGGCGTCTTGGTGGCGATCCTCTTTGCATTTCGATGGACAGCTCGTTGTGGATTCAAAAGGAGCTAGTGGTGGTTTGATGATCTTTTGGATAGATTCTTGTGTGCTTAATGTGTCCAGTTACTCTAATGGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809017.1
MNVLVWNARGLGSSRAFHELHRLIAGTSSSVLFISEMKVTAKKASWWRSSLHFDGQLVVDSKGASGGLMIFWIDSCVLNVSSYSNGHIDCMIKTNEMWWRFTGFYGNPDTQQRKHSWSLMRRLACSGSMDIPWLLGGDFNEITKRAECCERSKRSWAQMEEFNNTLQYCGVKTIPSDSMFSWYNPRKMKDARLLRLDRFLGNRLLDDVFEFNVVRTLDTHGSDHNPLLLTLTPTDDRPEQGNGYKRFFFEQKWLLDKSFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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