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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002878`

染色体: Chr04 坐标: 44955633-44956343 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002878`
名称	SmilChr04G002878
描述	uncharacterized SmilChr04G002878
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44955633 - 44956343 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023496`
GeneID	`131023496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023496`
原始查询	`LOC131023496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=28.9; qcov=0.733; evalue=4.58e-20; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=20.8; qcov=0.797; evalue=6.74e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809022.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057809022.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44955645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B30,B6,B64
`Chr4:44955649`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr4:44955649`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B52
`Chr4:44955659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B74,C24,D11
`Chr4:44955663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B30,B6,B64
`Chr4:44955669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B125,B86,C11,C72
`Chr4:44955729`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B78,B83,C3,C59
`Chr4:44955729`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B78,B83,C3,C59
`Chr4:44955737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:44955801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B94
`Chr4:44955830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr4:44955854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B67,C17,C52,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809022.1

236 aa

118

236

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 164-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809022.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	164	210	1.3e-06	28.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953039.1
ATGAAGAATAATCGCCCTTATTTTGACGTTCCGGATGAGATCTACAATCAACAACTTCAACGTTTTAAATTTTCGCTCCATGCGCGATTATTGTTACAAAAAGGCGATTCTCCGCGCTTTGCAGATGATATCAAGAATGAATTGCAAGCCTTTTGGGCTGTCTCGGCGCCGTGGCAAGTTGTGCCGCTGGGTAAAGGCTTTTTTACGCTTAGATTTTCGGGGGAAAGTGATTTGATGCAGGCAAAATCTAAAGCTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023496
ATGAAGAATAATCGCCCTTATTTTGACGTTCCGGATGAGATCTACAATCAACAACTTCAACGTTTTAAATTTTCGCTCCATGCGCGATTATTGTTACAAAAAGGCGATTCTCCGCGCTTTGCAGATGATATCAAGAATGAATTGCAAGCCTTTTGGGCTGTCTCGGCGCCGTGGCAAGTTGTGCCGCTGGGTAAAGGCTTTTTTACGCTTAGATTTTCGGGGGAAAGTGATTTGATGCAGGCAAAATCTAAAGCTTTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809022.1
MKNNRPYFDVPDEIYNQQLQRFKFSLHARLLLQKGDSPRFADDIKNELQAFWAVSAPWQVVPLGKGFFTLRFSGESDLMQAKSKAFWKLKLGILKIREWTLLFNPYKETVSHSQVWLCIYYLPHELWHPDLITGISRSVGTPIKIDGSTFLGAVGHFARVLIEMDVTKDIIYNLTVNRGSSSFEIEFVYENLPYYCGVCRKVGHSSDNCRQNALGKNEMPINSEKKELSCIKWGNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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