当前解析结果
SmilChr04G002944| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002944 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002944 |
| 描述 | glutenin, high molecular weight subunit PW212-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 45752997 - 45754427 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023508 |
|---|---|
| GeneID | 131023508 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023508 |
| 原始查询 | LOC131023508 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glutenin, high molecular weight subunit PW212-like |
| 产物 | glutenin%2C high molecular weight subunit PW212-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=26.9; qcov=0.224; evalue=2.98e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023508 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809033.1 |
| 2 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 1.00000 | XP_057809033.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057809033.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.60000 | XP_057809033.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057809033.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:45753012 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A25 |
Chr4:45753023 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,B27,B57 |
Chr4:45753029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:45753062 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,A25,B35,B64,C34 |
Chr4:45753074 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B20,B7,C58 |
Chr4:45753107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr4:45753107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:45753108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B129 |
Chr4:45753118 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B125,B90,B92,C87 |
Chr4:45753119 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B33,D10 |
Chr4:45753184 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B1,B22,B69,B93 |
Chr4:45753255 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B129,C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。