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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002959`

染色体: Chr04 坐标: 45952070-45952721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002959`
名称	SmilChr04G002959
描述	uncharacterized SmilChr04G002959
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45952070 - 45952721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023511`
GeneID	`131023511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023511`
原始查询	`LOC131023511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057809037.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809037.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809037.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809037.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45952106`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B33,C40
`Chr4:45952106`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B33,C40
`Chr4:45952138`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C28,C64
`Chr4:45952138`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C28,C64
`Chr4:45952149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B75,C21,C86
`Chr4:45952219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:45952224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B8
`Chr4:45952252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:45952290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B14,B50,D3
`Chr4:45952306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:45952441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr4:45952459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A16,B45,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809037.1

136 aa

136

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 15-54 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809037.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	15	54	8.4e-07	29.7	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953054.1
GAATCCGAGGTGGCAATCGGAATTCCAGCGTGTCATTGCCGGCAATTGAACGAGACGACGTCGTTTTAATTTTAATTAAACGACGTCGTTTCATGATTTGTTTACAGTTGAATTAGAAAATCTGAAATTAGGATTTGGGAAACACTTGGAGTCGCGATTAGGGTTCTTCGAGCAAAATGTCCGAAAGCTCGAATTCAGGAGCTTTGCAACCGGCTGCACAATGTGGATGTCGAATACCAGCCGTCCTTCGTGTATCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023511
ATGTCCGAAAGCTCGAATTCAGGAGCTTTGCAACCGGCTGCACAATGTGGATGTCGAATACCAGCCGTCCTTCGTGTATCTCACACCGAGAAAAATCCGTTTCGGCGATTCCTTTGTTGTAGCAATGTAAAGGGCGATTGTGGCATGTGGAAATGGGTGGATCCTGAGCTATCGCCGTATTACAAGACCACTGTACTGAGGTTGAAAGCTATGGCCGAGGACGGTGAAGCTGGAGATGGAAATTCCGATGGGTTGTGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809037.1
MSESSNSGALQPAAQCGCRIPAVLRVSHTEKNPFRRFLCCSNVKGDCGMWKWVDPELSPYYKTTVLRLKAMAEDGEAGDGNSDGLCFAKSNDGESICVDEVKTNLRKLENAVKNLEWKIRALVVLCVACVMVVYFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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