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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003032`

染色体: Chr04 坐标: 46772629-46773650 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003032`
名称	SmilChr04G003032
描述	uncharacterized SmilChr04G003032
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	46772629 - 46773650 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023519`
GeneID	`131023519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023519`
原始查询	`LOC131023519`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.3; qcov=0.434; evalue=1.53e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809047.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809047.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809047.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809047.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:46772631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A16,B121,B37
`Chr4:46772636`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B114
`Chr4:46772636`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B114
`Chr4:46772639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B11,B113,B45,C25
`Chr4:46772643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A6,B38,B49,B85
`Chr4:46772644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C87,D11
`Chr4:46772648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B88
`Chr4:46772650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B8,B80
`Chr4:46772664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:46772665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B37,B67,B70,C2
`Chr4:46772670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C17,C25
`Chr4:46772672`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809047.1

274 aa

137

274

PEG10_N-capsid

zf-CCHC

PF03732 PEG10_N-capsid 3-72 aa PF00098 zf-CCHC 202-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809047.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	3	72	1.5e-10	42.0	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057809047.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	202	217	5.3e-06	27.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953064.1
ATGGGCGACCCAGCCGAAGCTGAGGCTTGGGTACGCGCATTGGAGCGCATCTTCACTTTTCTTCGCTGCACGGAAGAGGAACGACTCTCGTGCGTGTCTTTCCAGCTAACGGGAGCGGCTGACTTTTGGTGGGAAGCCTGCCGAAAGACACTGACTCCCGAGCAATGGGCAGCCTACACATGGGAAAGCTTTAAGACTGGGTTATACGATAAGTATATTCCCAAAAGCTACAGGAAGAAGAAAGAGACTGAGTTCTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023519
ATGGGCGACCCAGCCGAAGCTGAGGCTTGGGTACGCGCATTGGAGCGCATCTTCACTTTTCTTCGCTGCACGGAAGAGGAACGACTCTCGTGCGTGTCTTTCCAGCTAACGGGAGCGGCTGACTTTTGGTGGGAAGCCTGCCGAAAGACACTGACTCCCGAGCAATGGGCAGCCTACACATGGGAAAGCTTTAAGACTGGGTTATACGATAAGTATATTCCCAAAAGCTACAGGAAGAAGAAAGAGACTGAGTTCTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809047.1
MGDPAEAEAWVRALERIFTFLRCTEEERLSCVSFQLTGAADFWWEACRKTLTPEQWAAYTWESFKTGLYDKYIPKSYRKKKETEFYNLRQGKRTVTEYDREFCDLSRYAPQQNFKGKRNWNNQGGSENPTNKKPWQGGAPSWQGGAPSWQGSAPFGQFQPQGQGKQKGPAPTGGNQRQNEVPPSPKCNKPHRGVCRAGTDDCYTCGQKGHYSSQCPNRQQGAAIRATYAQPLRAVPGQQQPRQQQPHQHQQRRQQQKQLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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