当前解析结果
SmilChr04G003036| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003036 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003036 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003036 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 46845670 - 46846062 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023521 |
|---|---|
| GeneID | 131023521 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023521 |
| 原始查询 | LOC131023521 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825439]; symbol=AT3G62650; hit=AT3G62650; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825439]; symbol=AT3G62650; hit=AT3G62650; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G62650 (AT3G62650)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825439] identity=30.2; qcov=0.992; evalue=3.11e-10; confidence=low |
| Rice | Os05g0576600- identity=41; qcov=0.6; evalue=3.52e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023521 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057809049.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809049.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809049.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809049.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809049.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:46845696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,A22,B103,B106,C67 |
Chr4:46845867 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B67,C21,C82 |
Chr4:46845915 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。