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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002117`

染色体: Chr01 坐标: 37189801-37193263 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002117`
名称	SmilChr01G002117
描述	uncharacterized SmilChr01G002117
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37189801 - 37193263 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023522`
GeneID	`131023522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023522`
原始查询	`LOC131023522`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI transamidase component Gpi16 subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819900]; symbol=AT3G07140; hit=AT3G07140; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GPI transamidase component Gpi16 subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819900]; symbol=AT3G07140; hit=AT3G07140; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G07140` (AT3G07140) GPI transamidase component Gpi16 subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819900] identity=63.1; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0479232` - identity=60.2; qcov=0.391; evalue=3.21e-89; confidence=low
GO	GO:0016255 (attachment of GPI anchor to protein); GO:0042765 (GPI-anchor transamidase complex)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04113 (Gpi16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809052.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057809052.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809052.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809052.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37190001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C16,D1
`Chr1:37190672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C31,C49
`Chr1:37190711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B22,B67,D10
`Chr1:37190716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:37190809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:37190985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B31
`Chr1:37190986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B22,B31,B76,C49
`Chr1:37191418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:37191493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B38,B39,C23
`Chr1:37191641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B67
`Chr1:37191687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:37191916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B21,C2,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809052.1

654 aa

327

654

Gpi16

PF04113 Gpi16 24-595 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809052.1`	Pfam	`PF04113`	Gpi16	Domain	24	595	1.5e-161	539.4	Gpi16 subunit, GPI transamidase component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953069.1
GAAATCGGGTTAAAAGAGAATTTCGTCGAGCTATGATCGAAGCTCCCATGGCGGAAAGTGCTCTGTCACCATACCTTCCTCATTCAAATTAACAATCTATTGATTCTTATTATACGGTAACAGTTTGATGAGTCGCGGATCAAATTATGAGGCTTTTGAAATTGTGCTTGTTGCTGTTTCTTGCATTGTTTTCGGCCACTGAATCGATTAAAGTAGAAGAACTGAATGAAGAGTTCACGGAGGCGTTGCTGCTGAGGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023522
ATGAGGCTTTTGAAATTGTGCTTGTTGCTGTTTCTTGCATTGTTTTCGGCCACTGAATCGATTAAAGTAGAAGAACTGAATGAAGAGTTCACGGAGGCGTTGCTGCTGAGGCCGCTTCCCGATCGAAAAGTTTTAGCTCATTTCCACTTCCGAAGCAGTGCGCCGCCGTCTCAAAGATATGGCCGCCACCATCACATCTTCCCTAAATCTATTTACCAGCTGGTTCATAAATTCCAAGTTCGAGAGATGGAGCTGTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809052.1
MRLLKLCLLLFLALFSATESIKVEELNEEFTEALLLRPLPDRKVLAHFHFRSSAPPSQRYGRHHHIFPKSIYQLVHKFQVREMELSFTQGRWNYERWGGFDPISSSNAKPPGVELWAEFDVPQDQVDDSWKNLTHALSGLFCASINFLEHSTSYSAPQWSFGSASGKLRYGTLPREAVCTENLTPWLKLLPCRDKAGLSSLMDRPSIYRGYYHSQRLHLKSDEFDASEMSIGIVLEQTLTVVLRPDTFSGKTLQPSWSLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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