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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003126`

染色体: Chr04 坐标: 47874381-47875766 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003126`
名称	SmilChr04G003126
描述	uncharacterized SmilChr04G003126
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	47874381 - 47875766 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023534`
GeneID	`131023534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023534`
原始查询	`LOC131023534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809062.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809062.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057809062.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809062.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809062.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:47874420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B94,C14,C15
`Chr4:47874427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B7,C84,D11,D9
`Chr4:47874453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C30,C4,C84
`Chr4:47874461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C29,D7
`Chr4:47874481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C29,C85
`Chr4:47874489`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A5,B44,B58,C41,C49,C61,D10
`Chr4:47874492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:47874581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A21,A4,B110,B132,B16,B17,B24,B29,B3,B56,B63,B91,C23,C29,C3,C32,C39,C47,C58,C7,C85,D2,D7
`Chr4:47874596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C15
`Chr4:47874634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr4:47874636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B123,B49
`Chr4:47874642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809062.1

272 aa

136

272

DUF7769

PF24964 DUF7769 7-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809062.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	7	60	9.9e-07	29.0	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953079.1
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTTCAAAACTCATCAAATGGGAAGCTTCACTATGGAACGGCCAAGGCAGCCATGGAGAAATGGGGATGTTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGCAAAGGAAGAACATGCACAAGTGTGTAGGCCGTTGTTTGATGAAGATGGAAGTGTATTATTCGATGGGAAGATATGGATTTTCCCGTTCACTGATATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023534
ATGACAAGAAGGAAAGATCTCAGCGGGGCCGAACGACAAGCCATTGCTTTGTTTCTTCTTCAAAACTCATCAAATGGGAAGCTTCACTATGGAACGGCCAAGGCAGCCATGGAGAAATGGGGATGTTGTCGGAGTTCTATCGCCCGTTTGTGGAAGGCTGCAAAGGAAGAACATGCACAAGTGTGTAGGCCGTTGTTTGATGAAGATGGAAGTGTATTATTCGATGGGAAGATATGGATTTTCCCGTTCACTGATATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809062.1
MTRRKDLSGAERQAIALFLLQNSSNGKLHYGTAKAAMEKWGCCRSSIARLWKAAKEEHAQVCRPLFDEDGSVLFDGKIWIFPFTDMVPAKRKSKNREAGTLEEKPIQSITKQVMKDMYIYKLIPAIMAKWPQFASKTIYIHQDNAKPHIKDDDPDFRAAASANGFDIRIIHQPPNSPDTNINDLGWFRAIQSLQVQAVSSNETELVQAVQKSFEELSAVTLNNVFLSLQGCYTEIMKVKGQNCYKIPHMKKGMLARQGNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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