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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003191`

染色体: Chr04 坐标: 48632178-48633482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003191`
名称	SmilChr04G003191
描述	uncharacterized SmilChr04G003191
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	48632178 - 48633482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023543`
GeneID	`131023543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023543`
原始查询	`LOC131023543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.8; qcov=0.451; evalue=9.62e-15; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809072.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809072.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809072.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809072.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:48632496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A24,B104,B107,B128,B15,B22,B3,B38,B39,B58,B68,B9,B92,C63,D11,D4,D8
`Chr4:48632505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A24,B11,C42
`Chr4:48632505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B11,C42
`Chr4:48632508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A18,B35
`Chr4:48632508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B35
`Chr4:48632509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:48632559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A24,B104,B107,B112,B123,B128,B133,B22,B38,B39,B41,B58,B68,B72,B85,B90,B92,C59,C63,D11,D4,D8
`Chr4:48632571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A24,B104,B107,B112,B123,B128,B133,B22,B38,B39,B41,B58,B68,B72,B85,B90,B92,C35,C38,C59,C63,D11,D4,D8
`Chr4:48632574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A21,A3,A5,A7,B1,B107,B13,B136,B24,B4,B42,B43,B79,C13,C14,C48,C60,C71,C72,C8
`Chr4:48632578`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A13,A14,A2,B120,B128,B19,B37,B40,B68,B78,B92,C79
`Chr4:48632580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B90,C1,C86
`Chr4:48632600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B83,C11,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809072.1

266 aa

133

266

PEG10_N-capsid

zf-CCHC

PF03732 PEG10_N-capsid 3-72 aa PF00098 zf-CCHC 201-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809072.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	3	72	5e-11	43.5	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057809072.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	201	217	4.1e-06	27.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953089.1
ATGGGCGACCCAGCCGAAGCTGAGGCTTGGGTACGCGCATTGGAGCGCATCTTCACTTTTCTTCGCTGCACGGAAGAGGAACGACTCTCGTGCGTGTCTTTCCAGCTAACGGGAGCGGCTGACTTTTGGTGGGAAGCCTTCCGAAAGACACTGACTCCCGAGCAATGGGCAGCCTACACATGGGAAAGCTTTAAGACTGGGTTATACGATAAGTATATTCCCAAAAGCTACAGGAAGAAGAAAGAGACTGAGTTCTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023543
ATGGGCGACCCAGCCGAAGCTGAGGCTTGGGTACGCGCATTGGAGCGCATCTTCACTTTTCTTCGCTGCACGGAAGAGGAACGACTCTCGTGCGTGTCTTTCCAGCTAACGGGAGCGGCTGACTTTTGGTGGGAAGCCTTCCGAAAGACACTGACTCCCGAGCAATGGGCAGCCTACACATGGGAAAGCTTTAAGACTGGGTTATACGATAAGTATATTCCCAAAAGCTACAGGAAGAAGAAAGAGACTGAGTTCTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809072.1
MGDPAEAEAWVRALERIFTFLRCTEEERLSCVSFQLTGAADFWWEAFRKTLTPEQWAAYTWESFKTGLYDKYIPKSYRKKKETEFYNLRQGKRTVTEYDREFCDLSRYAPQQNFKGKRNWNNQGGSENPTNKKPWQGGAPSWQGGAPSWQGSAPFGQFQPQGQGKQKGPAPTGGNQRQNKVPPSPKCNKPHRGVCRAGTDGCYTCGQKGHYSSQCPNRQQGAAIRATYAQPLRAVPGQQQPRQQQPHQHQQRRQQQKQLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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