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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003248`

染色体: Chr04 坐标: 49239397-49240589 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003248`
名称	SmilChr04G003248
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49239397 - 49240589 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023548`
GeneID	`131023548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023548`
原始查询	`LOC131023548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT3G18180` (AT3G18180) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821345] identity=43.1; qcov=0.959; evalue=6.95e-80; confidence=medium
Rice	`Os03g0567600` (OsXAT3) - identity=42.4; qcov=1.02; evalue=1.14e-80; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04577 (Glyco_transf_61)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057809076.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057809076.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809076.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809076.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49239602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B84,B9,C56
`Chr4:49239776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:49239890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:49239939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A5,B107,B111,B118,B127,B138,B140,B24,B41,B46,B54,B55,B8,B89,C11,C50,C58,C6,C71,C77
`Chr4:49240045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:49240130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:49240132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809076.1

317 aa

158

317

Glyco_transf_61

PF04577 Glyco_transf_61 38-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809076.1`	Pfam	`PF04577`	Glyco_transf_61	Family	38	221	3.1e-17	63.8	Glycosyltransferase 61

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953093.1
TCCGTGCAGATTGTGACATCTTCAACTACTCCAACTCTAGATCCGACGTGTACGAATTAAACGGCGACGTACGCATCCACGGCGCCTCTTCCACCATTTTCATACCACCTTCAAACCACCTGACCTCCATCAAAATAAAACCCTACCCACGAAAATACGACGCCGCCGCCATGACCACCGTCTCCGCTTTCCAAATCAAGGCAGACAAACTCCCTCATTGCACCCAAACCCTCGCCGCCCCGGCCATCCTCTTCTCGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023548
ATGACCACCGTCTCCGCTTTCCAAATCAAGGCAGACAAACTCCCTCATTGCACCCAAACCCTCGCCGCCCCGGCCATCCTCTTCTCGACCGGCGCACACGCCGGAAACCACTTCCACAGCATCGCCGACGTGCTCGTCCCGCTCTTCGCCACCTCCCACCGCTTCAACCGCCACGTCATCTTCCTCGTGACCAACCACGATTCTCGCCTCACTTCCAAGCACACCAAAACCCTACAAAGACTCTCCAAATACGACGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809076.1
MTTVSAFQIKADKLPHCTQTLAAPAILFSTGAHAGNHFHSIADVLVPLFATSHRFNRHVIFLVTNHDSRLTSKHTKTLQRLSKYDVVDIDAQNQTLCFPGMIVGLRAHTTDLSIDPSPFSSFSARNFTKLLRSAYSLERESVRGHYRPRMLIISRARSRRLSNEVEVVELARSLGFECVAQDLRGEIESVAKIVNSVDVMVGVHGAGLTNMVFLPENGVVIQITPVGLHNFAKQCYGSAEEEMKLKYLEYKVRLNESSLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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