Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003258`

染色体: Chr04 坐标: 49301026-49301790 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003258`
名称	SmilChr04G003258
描述	uncharacterized SmilChr04G003258
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49301026 - 49301790 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023550`
GeneID	`131023550`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023550`
原始查询	`LOC131023550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26133 (DUF8039)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023550

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809077.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809077.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057809077.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809077.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809077.1

206 aa

103

206

DUF8039

PF26133 DUF8039 4-58 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809077.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	4	58	1e-10	42.6	Domain of unknown function (DUF8039)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953094.1
ATGGTTGCTGGAGATGTCCTTCACGGATCTCCCTTTCCTGAAGACTGCTTACGTGTGGCGATTGATGAGGTTGTTGATGATAATGCACGATTACCCAAACCTATTTCAGATGACATGGTTACAGTGGGAAATGCATTAGGAACCCATGTAGCATGGCCTACTCATTTGGTGGTGGAGAAATCAATTGAGAAACCTGATAAGAAGACACGTGGAAAAAAGATTTTGAAAGAGTCCGCGGTGAAGAATTTGTCATCATTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023550
ATGGTTGCTGGAGATGTCCTTCACGGATCTCCCTTTCCTGAAGACTGCTTACGTGTGGCGATTGATGAGGTTGTTGATGATAATGCACGATTACCCAAACCTATTTCAGATGACATGGTTACAGTGGGAAATGCATTAGGAACCCATGTAGCATGGCCTACTCATTTGGTGGTGGAGAAATCAATTGAGAAACCTGATAAGAAGACACGTGGAAAAAAGATTTTGAAAGAGTCCGCGGTGAAGAATTTGTCATCATTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809077.1
MVAGDVLHGSPFPEDCLRVAIDEVVDDNARLPKPISDDMVTVGNALGTHVAWPTHLVVEKSIEKPDKKTRGKKILKESAVKNLSSLPSSLVALYCMMEKSFAGEGIRLPIDFEMFGQDLSVWILLKDDVIPFCNLEPITGNSIIAYICHSYGKMKTEGSLGRFMFVNPFTVSHNRQDSTETRARKLADRLLQALSNQLVLVPCNVG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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