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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003273`

染色体: Chr04 坐标: 49418987-49419914 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003273`
名称	SmilChr04G003273
描述	armadillo repeat-containing protein LFR-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49418987 - 49419914 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023553`
GeneID	`131023553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023553`
原始查询	`LOC131023553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	armadillo repeat-containing protein LFR-like
产物	armadillo repeat-containing protein LFR-like
Arabidopsis	`AT3G22990` (LFR) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821873] identity=64.6; qcov=1; evalue=7.53e-131; confidence=high
Rice	`Os07g0609766` (LFR) - identity=67; qcov=1; evalue=1.23e-154; confidence=high
GO	GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016514 (SWI/SNF complex); GO:0031491 (nucleosome binding); GO:0035060 (brahma complex); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809081.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809081.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057809081.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809081.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49418997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:49419038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:49419077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A23,B69
`Chr4:49419077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr4:49419105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,D6
`Chr4:49419127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,B99,C37
`Chr4:49419140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B76,C45
`Chr4:49419146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr4:49419148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B63
`Chr4:49419151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C37
`Chr4:49419155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B105,B110,B29,C22
`Chr4:49419160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953098.1
CTCCAGGTCCACTCTGCCTTCGCCGAGCAGAATAACAAAAGGATAGTTATGGCTCTTCAAAGTGGATTGAAGAGTGAGTTGACATGGGCATTGAAGGCTCTCACATTGCTTTCGTTCAAAGAGAAAGATGAAGTCAAAAAGGATGCAACTCCTCTTGCCCGGATTCCTGGATTGCTTGATGCTCTACTTCAAGTTATAGATGACTGGCGTGACATAGCTCTACCAAGAGTTCTCGCAAAGACACCAAGGGCGAGACTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023553
CTCCAGGTCCACTCTGCCTTCGCCGAGCAGAATAACAAAAGGATAGTTATGGCTCTTCAAAGTGGATTGAAGAGTGAGTTGACATGGGCATTGAAGGCTCTCACATTGCTTTCGTTCAAAGAGAAAGATGAAGTCAAAAAGGATGCAACTCCTCTTGCCCGGATTCCTGGATTGCTTGATGCTCTACTTCAAGTTATAGATGACTGGCGTGACATAGCTCTACCAAGAGTTCTCGCAAAGACACCAAGGGCGAGACTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809081.1
LQVHSAFAEQNNKRIVMALQSGLKSELTWALKALTLLSFKEKDEVKKDATPLARIPGLLDALLQVIDDWRDIALPRVLAKTPRARLLGANSAVTGFGSEYETVNSGDSVPHPTAGSGSSNKDLSAQKSSSKSRHSGWWFEEDGLFNLDDEGRAEKQQCAIAASNIIRNFSFMAENELAMGQNRHCLETMFQCLEDYVTEDEELVTNTLETIMNLGPLLDLRIFSSSKPSFIKMTEKRALQAIMGMLGSAVRGWHCAAAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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