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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003277`

染色体: Chr04 坐标: 49463311-49464141 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003277`
名称	SmilChr04G003277
描述	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49463311 - 49464141 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023554`
GeneID	`131023554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023554`
原始查询	`LOC131023554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 2
产物	glucuronoxylan 4-O-methyltransferase 2
Arabidopsis	`AT4G24910` (AT4G24910) glucuronoxylan 4-O-methyltransferase-like protein (DUF579) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828593] identity=39.9; qcov=1.12; evalue=5.19e-63; confidence=medium
Rice	`Os12g0204500` - identity=39.9; qcov=0.699; evalue=6.72e-40; confidence=medium
GO	GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF21729 (IRX15_IRX15L_GXM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057809082.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809082.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809082.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809082.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49463509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B21,B54,C15
`Chr4:49463632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C50
`Chr4:49463743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:49463826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:49463871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr4:49463872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B103,C28,C67
`Chr4:49463901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:49463908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:49463956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:49464040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B59,B86
`Chr4:49464065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:49464081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809082.1

276 aa

138

276

IRX15_IRX15L_GXM

PF21729 IRX15_IRX15L_GXM 89-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809082.1`	Pfam	`PF21729`	IRX15_IRX15L_GXM	Domain	89	265	3.5e-59	200.2	IRX15/IRX15L/GXM

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953099.1
ATGCCACCAGAAGTAGCACATTATCACCATCCTAGCCTCACTCCCAAAACTCCCCTGCTCGCCCGCCTCAAGCATCGCCAGCAGGGGAGGATGAAATTCGCGAAGAAGAAGATCATCCCGCTTCTACTTTTCATCTTGTGCAGTGCTTCCATCTTCCGGTTTCTGAACACCAGCACCATCTTCGCCAACTTCTCCGCATCTCTACCTTCCCAGCCCTACCCACGGGCTCCCTCCACAGACGACGACAGCAGTTTAACAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023554
ATGCCACCAGAAGTAGCACATTATCACCATCCTAGCCTCACTCCCAAAACTCCCCTGCTCGCCCGCCTCAAGCATCGCCAGCAGGGGAGGATGAAATTCGCGAAGAAGAAGATCATCCCGCTTCTACTTTTCATCTTGTGCAGTGCTTCCATCTTCCGGTTTCTGAACACCAGCACCATCTTCGCCAACTTCTCCGCATCTCTACCTTCCCAGCCCTACCCACGGGCTCCCTCCACAGACGACGACAGCAGTTTAACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809082.1
MPPEVAHYHHPSLTPKTPLLARLKHRQQGRMKFAKKKIIPLLLFILCSASIFRFLNTSTIFANFSASLPSQPYPRAPSTDDDSSLTEKETRFILRLLSRRVPCNLLVFGSADEYSSMASLNSGGLTIFVEDYGEKTSKENSNARVHKIVYDTKASEAYQLLRDARGNPDCLPESHMRCRLALRNLPREVYDTTWDVVVVDGPGGGTAESPGRMGSIYTAGLLARRGGNSSEVIVHDVDRMIEKWFSWEFLCEDNLVSSKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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