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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003311`

染色体: Chr04 坐标: 49841414-49842047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003311`
名称	SmilChr04G003311
描述	uncharacterized SmilChr04G003311
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	49841414 - 49842047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023558`
GeneID	`131023558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023558`
原始查询	`LOC131023558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809085.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057809085.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809085.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809085.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:49841441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr4:49841509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B122,B26,B43,C41
`Chr4:49841527`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr4:49841527`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr4:49841556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A23,B41
`Chr4:49841556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B41
`Chr4:49841641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A24,B127,B47,B96,C42,C68,C76,C83,C85
`Chr4:49841643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C67
`Chr4:49841646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B30,B8,B93
`Chr4:49841654`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A14,A15,A18,A7,C1,C13,C35,C45,C75,C86
`Chr4:49841665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B105,B24,B35,B65,C80,D2,D7
`Chr4:49841683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953102.1
GGAAAAGCAACATAAACACTGAGCATCTATTGAAGAAGAAGGAACACCATTCATTTTGCAGTACAGTCCCACTGCGGATGGCAGCAAGAAGAGAGCAAAGAAAATGGCCGCGAGGTATGAGGGGGTCAGAATGATTCAAGAACAAAGGATAGAGAGCGAAGGAGAAGGAAGAAACCAGCAACAGCAAGAGCATCAACAACAGCAACATCAACAACAACAGCAGGGAGAGGCTGTGATGACATTCACAGCCTCGGAAATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023558
ATGGCCGCGAGGTATGAGGGGGTCAGAATGATTCAAGAACAAAGGATAGAGAGCGAAGGAGAAGGAAGAAACCAGCAACAGCAAGAGCATCAACAACAGCAACATCAACAACAACAGCAGGGAGAGGCTGTGATGACATTCACAGCCTCGGAAATGAAGCAATTTATTGAAAAAGTGGGAGAAAGCGCAGCAAAGAGAGCGCGCATTGAATTTGTTGAACATTTCAATCGGGAAGAGCTGATAAATGACATAGCTGACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809085.1
MAARYEGVRMIQEQRIESEGEGRNQQQQEHQQQQHQQQQQGEAVMTFTASEMKQFIEKVGESAAKRARIEFVEHFNREELINDIADCVVSKLRQRQQYRPPQEVASTAEWMAHCETEERFYRQVWGTPASMPTPTPTPTPPAMQTLKPEYQPQRQH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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