当前解析结果
SmilChr04G003312| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003312 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003312 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003312 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 49842026 - 49843090 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023559 |
|---|---|
| GeneID | 131023559 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023559 |
| 原始查询 | LOC131023559 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023559 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057809086.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057809086.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057809086.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809086.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809086.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:49842029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,C52,C55 |
Chr4:49842040 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A1,A15,B21,B26,B86,C52,C55 |
Chr4:49842041 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C27 |
Chr4:49842054 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:49842201 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr4:49842209 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr4:49842219 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B104,B24,C58 |
Chr4:49842413 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,B8 |
Chr4:49842451 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr4:49842460 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,C15,C51,C77 |
Chr4:49842463 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C48 |
Chr4:49842494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 90 | A20,A21,A22,A23,A24,A25,A7,A9,B100,B102,B104,B106,B108,B109,B111,B113,B12,B125,B126,B130,B131,B133,B135,B15,B17,B2,B20,B21,B23,B24,B29,B32,B35,B4,B41,B45,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B58,B60,B61,B62,B65,B67,B72,B73,B75,B76,B8,B81,B83,B91,B93,C1,C11,C18,C19,C21,C27,C29,C30,C37,C44,C47,C48,C5,C51,C52,C57,C60,C63,C64,C67,C68,C69,C7,C72,C73,C79,C8,C87,C9,D10,D11,D4,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。