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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003364`

染色体: Chr04 坐标: 50227265-50227674 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003364`
名称	SmilChr04G003364
描述	uncharacterized SmilChr04G003364
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50227265 - 50227674 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023564`
GeneID	`131023564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023564`
原始查询	`LOC131023564`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0595300` - identity=30.9; qcov=0.8; evalue=1.46e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057809092.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809092.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809092.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809092.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50227269`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr4:50227269`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:50227280`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C73
`Chr4:50227280`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C73
`Chr4:50227307`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A15,A5,B102,B109,B23,B48,B49,B69,B70,B71,B79,B82,B93,C20,C3,C36,C62,C65,C70
`Chr4:50227426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	145	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A3,A7,B1,B10,B100,B101,B107,B108,B113,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B15,B16,B17,B18,B19,B21,B23,B24,B29,B3,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B47,B5,B50,B52,B57,B58,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B7,B72,B75,B78,B79,B80,B81,B82,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C41,C43,C47,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C86,C87,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr4:50227433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B76,C10,C16,D5
`Chr4:50227535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B4,B89,C19,C86
`Chr4:50227552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C3
`Chr4:50227604`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A10,B106,B137,B5,B67,B73,B8,B91,C1,C15,C26,C3,C32,C34,C48,C73,D10,D11,D2
`Chr4:50227622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B50,B97,C16,C57
`Chr4:50227623`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A3,B1,B10,B100,B101,B107,B108,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B15,B17,B18,B19,B21,B23,B24,B27,B29,B3,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B47,B5,B50,B52,B57,B58,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B72,B78,B79,B81,B82,B85,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C41,C43,C47,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C56,C6,C66,C67,C68,C69,C71,C73,C74,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C86,C87,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953109.1
ATGGAGGTGAATCCAATCAATGCATTCAAATTCATAGTTTCTTCTGGTTTTCGGAAGTATGTTGTTGATCTTCGTGCTAGGAGTTGTTCTTATCATGAGTTTGATCTTGACTTGATTCCTTGCCCTCATGATGTTGCCGCTATATTCAAGTCGAAGCAATCTTGTATTCCATATGTTTCTAGTTACTACATTATAAAGACCTTACGTGAGATGTATTTTGTTGATGTGAATCATATCCCACATCAAGACGAGTGGGATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023564
ATGGAGGTGAATCCAATCAATGCATTCAAATTCATAGTTTCTTCTGGTTTTCGGAAGTATGTTGTTGATCTTCGTGCTAGGAGTTGTTCTTATCATGAGTTTGATCTTGACTTGATTCCTTGCCCTCATGATGTTGCCGCTATATTCAAGTCGAAGCAATCTTGTATTCCATATGTTTCTAGTTACTACATTATAAAGACCTTACGTGAGATGTATTTTGTTGATGTGAATCATATCCCACATCAAGACGAGTGGGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809092.1
MEVNPINAFKFIVSSGFRKYVVDLRARSCSYHEFDLDLIPCPHDVAAIFKSKQSCIPYVSSYYIIKTLREMYFVDVNHIPHQDEWDVPLNVRTKVVDVPQNPRQA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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