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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003402`

染色体: Chr04 坐标: 50594517-50595143 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003402`
名称	SmilChr04G003402
描述	uncharacterized SmilChr04G003402
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50594517 - 50595143 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023568`
GeneID	`131023568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023568`
原始查询	`LOC131023568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=30.1; qcov=0.88; evalue=8.47e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=33.9; qcov=0.938; evalue=3.27e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809095.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809095.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50594522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:50594551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B60
`Chr4:50594586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:50594596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C79
`Chr4:50594598`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A19,A20,A8,B105,B11,B111,B129,B26,B40,B49,B54,B71,B72,B73,B74,B8,B83,B90,B97,C16,C52,C54,C57,C75,C78,C81,C82,C9,D1,D3
`Chr4:50594619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B118,B88,C58,C83
`Chr4:50594621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:50594634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B54,B9,C15,C54,C56
`Chr4:50594661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A23,A25,A7,A8,B107,B125,B30,B35,B5,C23,C4,C61,C63,C70,C83,C87,C9,D2,D9
`Chr4:50594710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:50594728`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A4,A9,B105,B78,C19,C30,C31,C35,C45,C46,C50,C53,C74
`Chr4:50594748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953112.1
ATGGAGAAAAATTTCATCCATCCTGCCAAGATTGGCAAAGATGATATCAGGATTTCCCATCTCCAGTACGTTGACGATACAATTTTTTTACTTGAGGACAAGGAGAGCAACGCAGTGGCTCTGAGGTATATGTTAAACATTTTCCAGTTGATCTCTGGGTTGGCGGTGAATTTCAGTAAAAGCAGCTTGATCGGAATAGAGGTTGAAGACACAAAAATCGAGAGGATGGCAGCTGAACTCAGATGCAAAGTGGGAGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023568
ATGGAGAAAAATTTCATCCATCCTGCCAAGATTGGCAAAGATGATATCAGGATTTCCCATCTCCAGTACGTTGACGATACAATTTTTTTACTTGAGGACAAGGAGAGCAACGCAGTGGCTCTGAGGTATATGTTAAACATTTTCCAGTTGATCTCTGGGTTGGCGGTGAATTTCAGTAAAAGCAGCTTGATCGGAATAGAGGTTGAAGACACAAAAATCGAGAGGATGGCAGCTGAACTCAGATGCAAAGTGGGAGACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809095.1
MEKNFIHPAKIGKDDIRISHLQYVDDTIFLLEDKESNAVALRYMLNIFQLISGLAVNFSKSSLIGIEVEDTKIERMAAELRCKVGDCPFNYLGLKIGVGSNKVVNWSYLVDKVKKRVNGWTTRTLSLAGRITLVKSVLMVIPIYQLSFSCIPKQPLSLNSIFCKFLWGESANLGSIPWVKWNDLCTDFKDGGLGFKNLDWFNVALVSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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